| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 602,585 | T→C | L60L (TTA→CTA) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 602,585 | 0 | T | C | 100.0% | 234.1 / NA | 77 | L60L (TTA→CTA) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (44/33); total (44/33) | |||||||||||
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tATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATGTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagc < 1:450445‑M1/251‑72 (MQ=255) aTTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGc < 1:12373/52‑1 (MQ=255) aTTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGt < 1:323485/131‑1 (MQ=255) aTTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagca > 1:557638‑M1/1‑179 (MQ=255) 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gaATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCTGGCGGTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGcaaacaa < 1:136009/222‑1 (MQ=255) aaTGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagcagcttagaaa > 1:709535‑M1/1‑170 (MQ=255) aaTGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagcagcttagaaa < 1:793022‑M1/251‑82 (MQ=255) aaTGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagcagcttagaaa < 1:830664‑M1/251‑82 (MQ=255) gtgCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataag < 1:498614‑M1/237‑71 (MQ=255) aagagacatcacttggattttCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagcagcttagaaaatggt < 1:412469‑M1/242‑87 (MQ=255) cacTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGa > 1:91194/1‑93 (MQ=255) cacTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCTGGCGGTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGc > 1:571215/1‑210 (MQ=255) aTTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATGAATGATAGTTAAAAATAAGTTGACTGCCGGCAATTAAAAGGATTAAGATTTAAAATGCCAGAGCAATCtggcggtggcggttttatgcagcctgaaaggctgagtgttgaagcaaacaaagcttaactgctgaataagcagcttagaaaatggtagctcttacggaaag < 1:448613‑M1/250‑102 (MQ=255) | ACAGCTATTGATTGGCATATACGTGATTAACGCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATGAAAAAAACACTTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTTTACAAGATGCTGGAGCTAAATTTAATAGAGATGGGGCGTTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGACAGTTAAAAATAAGTTGGCTGCCGGCAATTAAAAGGAGTAAGATTTAAAACGCCAGAGCAATC‑‑‑‑‑‑TAGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAG > 1/602341‑602823 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |