| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 457,547 | T→C | I4T (ATA→ACA) | unknown → | Integrase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 457,547 | 0 | T | C | 100.0% | 288.4 / NA | 97 | I4T (ATA→ACA) | unknown | Integrase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (48/49); total (48/49) | |||||||||||
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CCCAAGGGCTTTTTTATATCCTAAGCGTTCCTACCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGATATAACTAAAATCGCACAAAACCTGTTAGAAAAAAGTGTTACCGATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTTGGAAAGAAGCGATATGGCACGCATAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGATAAAGCTAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTA‑CCCTATCCGATGGCAAAGGGCTTTATCTGTTGGTTAAGCCCAATGGGGCTAAGTTATGGCGG‑TTTAACTATTACAAGCCTTTCACGCAACCAAAGAAAAGAGCGTTAATTGGCGTTGGCAAATACCCTGATATTTCCTTACAACAAGCAAGAGCAATTAGAGAGGAATATTTATCTTTACTTGCG > 1/457304‑457791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |