| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 457,444 | G→T | intergenic (+803/‑93) | unknown → / → unknown | Uncharacterized protein YnbE/Integrase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 457,444 | 0 | G | T | 100.0% | 278.1 / NA | 97 | intergenic (+803/‑93) | unknown/unknown | Uncharacterized protein YnbE/Integrase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (53/44); total (53/44) | |||||||||||
GAATTTCGGACGGGGGTTCAACTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAATCCAAAGCAAACTTATCAAATCCCAAAAGCCCTTGAAAATATTAACCCCAAGGGCTTTTTTATATCCTAAGCGTTCCTACCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGATATAACTAAAATCGCACAAAACCTGTTAGAAAAAAGTGTTACCGATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTTGGAAAGAAGCGATATGGCACGCATAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGATAAAGCTAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTACCCTATCCGATGGCAAAGGGCTTTATCTGTTGGTTAAGCCCAATGGGGCTAAGTTATGGCGGTT > 1/457211‑457670 | gAATTTCGGACGGGGGTTCAACTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAAACCAAAGCAAACTTATCAAATCCTAAAAGCCCTTGAAAGTATTAACTTTAAGGGC‑TTTTTATATCCTAAGCGTTCCTATCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGc < 1:598667/249‑1 (MQ=255) 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atacaAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATGGCACGCACAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGACAAAGCCAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTACCCTATCCGATGGCAAAGGGCTTTATCTGTTGGTTAAACCCAATGGGGCTAAGTTATGGCGGtt > 1:616876/3‑251 (MQ=255) tacaAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATGGCACGCACAATCACACCGCTAAAc > 1:265107/2‑143 (MQ=255) ccTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAg > 1:467233/1‑53 (MQ=255) cTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAActctcagaac > 1:526063/1‑94 (MQ=255) | GAATTTCGGACGGGGGTTCAACTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAATCCAAAGCAAACTTATCAAATCCCAAAAGCCCTTGAAAATATTAACCCCAAGGGCTTTTTTATATCCTAAGCGTTCCTACCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGATATAACTAAAATCGCACAAAACCTGTTAGAAAAAAGTGTTACCGATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTTGGAAAGAAGCGATATGGCACGCATAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGATAAAGCTAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTACCCTATCCGATGGCAAAGGGCTTTATCTGTTGGTTAAGCCCAATGGGGCTAAGTTATGGCGGTT > 1/457211‑457670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |