| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 457,436 | A→C | intergenic (+795/‑101) | unknown → / → unknown | Uncharacterized protein YnbE/Integrase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 457,436 | 0 | A | C | 100.0% | 296.4 / NA | 97 | intergenic (+795/‑101) | unknown/unknown | Uncharacterized protein YnbE/Integrase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (53/44); total (53/44) | |||||||||||
GCTAACGGCAGAGGAATTTCGGACGGGGGTTCAACTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAATCCAAAGCAAACTTATCAAATCCCAAAAGCCCTTGAAAATATTAACCCCAAGGGCTTTTTTATATCCTAAGCGTTCCTACCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGATATAACTAAAATCGCACAAAACCTGTTAGAAAAAAGTGTTACCGATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTTGGAAAGAAGCGATATGGCACGCATAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGATAAAGCTAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTACCCTATCCGATGGCAAAGGGCTTTATCTGTTGGTTAAGCCCAATGGGGCTAAGTTATGGCGGTT > 1/457198‑457670 | gCTAACGGCAGAGGAATTTCGGACGGGGGTTCAACTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAAACCAAAGCAAACTTATCAAATCCTAAAAGCCCTTGAAAGTATTAACTTTAAGGGC‑TTTTTATATCCTAAGCGTTCCTATCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGcaaaaggtttta > 1:359510/1‑242 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1:882528/1‑177 (MQ=255) ccGTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATgg < 1:575303/151‑1 (MQ=255) ccGTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATGGCACGCACAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGACAAAGCCAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTACCCTATCCg < 1:350616/226‑1 (MQ=255) gTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATGGCACGCACAATCACACCGCTAAAc > 1:179572/1‑172 (MQ=255) gTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATGGCACGCACAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGac < 1:351965/187‑2 (MQ=255) 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aactaaaaccatacaAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATGGCACGCACAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGACAAAGCCAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTACCCTATCCGATGGCAAAGGGCTTTATCTGTTGGTTAAACCCAATGGGGCTAAGt > 1:849143/13‑251 (MQ=255) aactaaaaccatacaAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATGGCACGCACAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGACAAAGCCAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTACCCTATCCGATGGCAAAGGGCTTTATCTGTTGGTTAAACCCAATGGGGCTAAGt > 1:288840/13‑251 (MQ=255) aactaaaaccatacaAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATGGCACGCACAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGACAAAGCCAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTACCCTATCCGATGGCAAAGGGCTTTATCTGTTGGTTAAACCCAATGGGGCTAAGt < 1:728611/239‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ccTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAg > 1:467233/1‑53 (MQ=255) cTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAActctcagaac > 1:526063/1‑94 (MQ=255) | GCTAACGGCAGAGGAATTTCGGACGGGGGTTCAACTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAATCCAAAGCAAACTTATCAAATCCCAAAAGCCCTTGAAAATATTAACCCCAAGGGCTTTTTTATATCCTAAGCGTTCCTACCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGATATAACTAAAATCGCACAAAACCTGTTAGAAAAAAGTGTTACCGATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTTGGAAAGAAGCGATATGGCACGCATAATCACACCGCTAAACAGCACGAAAATAGATAAAGCTAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTACCCTATCCGATGGCAAAGGGCTTTATCTGTTGGTTAAGCCCAATGGGGCTAAGTTATGGCGGTT > 1/457198‑457670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |