| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 89,601 | A→G | T9T (ACT→ACC) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 89,601 | 0 | A | G | 100.0% | 245.2 / NA | 80 | T9T (ACT→ACC) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (50/30); total (50/30) | |||||||||||
ACCGCCAGATTGCTCGGACGGTTTGAATCTTACTCCTTTGATTAGTAACGGTCAACCCATTTCTTACCATCTTCTTTACTTGTGATCTCGTCAACCAGTAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGACGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTAGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACCACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACTCCCTCGGTTTTGCAGATTGCGTCGAATTCATCTACCACTTCCGGGCGGAGTTTG > 1/89359‑89845 | aCCGCCAGATTGCTCGGACGGTTTGAATCTTACTCCTTTGATTAGTAACGGTCAACCCATTTCTTACCATCTTCTTTACTTGTGATCTCGTCAACCAGTAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCg > 1:561169/1‑249 (MQ=255) 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cTCGGACGGTTTGAATCTTACTCCTTTGATTAGTAACGGTCAACCCATTTCTTACCATCTTCTTTACTTGTGATCTCGTCAACCAGTAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAg < 1:808758/250‑1 (MQ=255) cTCGGACGGTTTGAATCTTACTCCTTTGATTAGTAACGGTCAACCCATTTCTTACCATCTTCTTTACTTGTGATCTCGTCAACCAGTAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGt < 1:596171/251‑1 (MQ=255) gTTTGAATCTTACTCCTTTGATTAGTAACGGTCAACCCATTTCTTACCATCTTCTTTACTTGTGATCTCGTCAACCAGTAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCAttt > 1:73333/1‑251 (MQ=255) 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tttGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTg > 1:897955/1‑202 (MQ=255) gCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTg > 1:830204/1‑168 (MQ=255) gCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaa < 1:614995‑M2/251‑58 (MQ=255) gCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccac < 1:347183‑M2/222‑29 (MQ=255) ccTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaa > 1:180098‑M2/1‑193 (MQ=255) tGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataacta > 1:338358‑M2/1‑190 (MQ=255) tGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatat > 1:671224‑M2/1‑190 (MQ=255) cACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTg > 1:155178/1‑172 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |