| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 425,565 | T→G | F99L (TTT→TTG) | unknown → | Undecaprenyl diphosphate synthase (EC 2.5.1.31) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 425,565 | 0 | T | G | 100.0% | 250.9 / NA | 85 | F99L (TTT→TTG) | unknown | Undecaprenyl diphosphate synthase (EC 2.5.1.31) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (32/53); total (32/53) | |||||||||||
ACGGCAACGGGCGTTGGGCGAAACAGCAGGGCAAAATGCGCATTTTCGGGCATAAAAACGGCGTGGCGGCGGTGCGTGAGGCGGTGTCTTACGCGCGTAAAATCGGTGTGAAATATTTAACTTTATATGCGTTTAGCAGTGAAAACTGGAATCGCCCCGAGCAGGAAGTCAGTGCGCTGATGAATTTGTTTATGCAGGCGTTGGATTTTGAACTAAAAAAACTGCATAAAAATAATATTCGATTTAAGATTCTGGGCAATGTTGCGCGCTTCAGTGAAGGGTTACAGGAAAAAATTAAGAACGCGGAAAAATTAACGGAAAATAACACCGCACTTACTTTAAATATCGCGGCGAATTACGGCGGTCGTTGGGACATTGTACAGGCGGCACAACAGCTGGCACAAAAAGTACAGACGCAACAACTTGCCGTAACGGAAATTGACGAAGCGTTGTTGCAACAACATTTGGTTACGCAAGACGATCCGGAAG > 1/425321‑425809 | aCGGCAACGGGCGTTGGGCGAAACAGCAGGGCAAAATGCGCATTTTCGGGCATAAAAACGGCGTGGCGGCGGTGCGTGAGGCGGTGTCTTACGCGCGTAAAATCGGTGTGAAATATTTAACTTTATATGCGTTTAGCAGTGAAAACTGGAATCGCCCCGAGCAGGAAGTCAGTGCGCTGATGAATTTGTTTATGCAGGCGTTGGATTTTGAGCTAAAAAAACTGCATAAAAATAATATTCGATTGAAGAt < 1:669946/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |