| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 407,362 | A→G | *57W (TGA→TGG) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 407,362 | 0 | A | G | 100.0% | 272.5 / NA | 93 | *57W (TGA→TGG) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (46/47); total (46/47) | |||||||||||
TAATATGCCGTCCTCAACGTTGTCCCGCCAAATTCAAGTGAAGAAGAACCAGGGTATGGCACGAGGGCATTGTGTCTATGATGGCGCCGGGCTGCGGGTTGGCGTTGTTGCCGGATGTGGTGATGAAAAACAGTCCATTGAACAATCAGATTTCCACGTTGCAATTAGATGTGCCTATTGCGCCTTTCGAATTAGGCGTGTGCGCCTTAAAACCTGCGTTGGAGCGCCCTTTAGTGCGTGCATTTTGAGATTTGTTGGAGTAAAGTGCGGTCATTATCTAAGGAGTTTTTTCACCATGTTAAAAGGCATCGCATTTTCATTATTTGCCTCCCTACTGTTCGGCTATATGTACTATTTTTCCACACTTCTGTTGCCTTTGAGCGGAACGGATATTTTCGGCTATCGCATTGTGTTCACCCTACCTTTCGTGGCGGCGGCAGTGGTGCTGTTTAAACAGCAAGCGGCACTTGTCGCCCATTTAAAA > 1/407115‑407598 | taataTGCCGTCCTCAACGTTGTCCCGCCAAATTCAAGTGAAGAAGAACCAGGGTATGGCACGAGGGCATTGTGTCTATGATGGCGCCGGGCTGCGGGTTGGCGTTGTTGCCGGATGTGGTGATGAAAAACAGTCCATTGAACAATCAGATTTCCACGTTGCAATTAGATGTGCCTATTGCGCCTTTCGAATTAGGCGTGTGCGCCTTAAAACCTGCGTTGGAGCGCCCTTTAGTGCGTGCATTTTGGGAt > 1:683760/1‑251 (MQ=255)taataTGCCGTCCTCAACGTTGTCCCGCCAAATTCAAGTGAAGAAGAACCAGGGTATGGCACGAGGGCATTGTGTCTATGATGGCGCCGGGCTGCGGGTTGGCGTTGTTGCCGGATGTGGTGATGAAAAACAGTCCATTGAACAATCAGATTTCCACGTTGCAATTAGATGTGCCTATTGCGCCTTTCGAATTAGGCGTGTGCGCCTTAAAACCTGCGTTGGAGCGCCCTTTAGTGCGTGCATTTTGGGAt > 1:567165/1‑251 (MQ=255) gTCCTCAACGTTGTCCCGCCAAATTCAAGTGAAGAAGAACCAGGGTATGGCACGAGGGCATTGTGTCTATGATGGCGCCGGGCTGCGGGTTGGCGTTGTTGCCGGATGTGGTGATGAAAAACAGTCCATTGAACAATCAGATTTCCACGTTGCAATTAGATGTGCCTATTGCGCCTTTCGAATTAGGCGTGTGCGCCTTAAAACCTGCGTTGGAGCGCCCTTTAGTGCGTGCATTTTGGGATTTGTTGGAg > 1:888165/1‑251 (MQ=255) gTCCTCAACGTTGTCCCGCCAAATTCAAGTGAAGAAGAACCAGGGTATGGCACGAGGGCATTGTGTCTATGATGGCGCCGGGCTGCGGGTTGGCGTTGTTGCCGGATGTGGTGATGAAAAACAGTCCATTGAACAATCAGATTTCCACGTTGCAATTAGATGTGCCTATTGCGCCTTTCGAATTAGGCGTGTGCGCCTTAAAACCTGCGTTGGAGCGCCCTTTAGTGCGTGCATTTTGGGATTTGTTGGAg > 1:338735/1‑251 (MQ=255) 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TAATATGCCGTCCTCAACGTTGTCCCGCCAAATTCAAGTGAAGAAGAACCAGGGTATGGCACGAGGGCATTGTGTCTATGATGGCGCCGGGCTGCGGGTTGGCGTTGTTGCCGGATGTGGTGATGAAAAACAGTCCATTGAACAATCAGATTTCCACGTTGCAATTAGATGTGCCTATTGCGCCTTTCGAATTAGGCGTGTGCGCCTTAAAACCTGCGTTGGAGCGCCCTTTAGTGCGTGCATTTTGAGATTTGTTGGAGTAAAGTGCGGTCATTATCTAAGGAGTTTTTTCACCATGTTAAAAGGCATCGCATTTTCATTATTTGCCTCCCTACTGTTCGGCTATATGTACTATTTTTCCACACTTCTGTTGCCTTTGAGCGGAACGGATATTTTCGGCTATCGCATTGTGTTCACCCTACCTTTCGTGGCGGCGGCAGTGGTGCTGTTTAAACAGCAAGCGGCACTTGTCGCCCATTTAAAA > 1/407115‑407598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |