| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 229,173 | A→G | I363M (ATA→ATG) | unknown → | Lysophospholipase (EC 3.1.1.5) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 229,173 | 0 | A | G | 100.0% | 287.5 / NA | 93 | I363M (ATA→ATG) | unknown | Lysophospholipase (EC 3.1.1.5) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (46/47); total (46/47) | |||||||||||
TCCGATTTACTGGTTATTTATTTTATTCTTCTTTTACTCATTTAATGGGTTAGTTGTCACTGTACAAATGCGTATGAAACAGGCAAAAAATTTCACAATAACCTTGATTGGCTGGACAATTAAAACGAGCTTTTTCGCGGTAAGTGGATTGGTACTTTTATGGTTATTTCACTTTATACCGGATTTTATGCAATTGGGACCGGGCTTTGATTTAATTGGACTTCCACAATTCGGTGGTCGCTGGATAATGATGTTATCAGTGATTATTCCACAATTTATTGTGTTGATTTTAATTAGCCATTGGTGTTATTTAAAAACAGGTTATGTGTATTTAGGCGTTTTTTTAACTTCAATATTAATGACATGGATTATTGTTGGCGGGCAGGTTATAGGGCGTTTCCTTGCCTAAAAAATAAAGATAAATTAAGCAGGCTATGCCGGGTCTCTGTATCCCGATACTTGGTTCAGGTTCGGTATCGAATTTTTT > 1/228927‑229413 | tCCGATTTACTGGTTATTTATTTTATTCTTCTTTTACTCATTTAATGGGTTAGTTGTCACTGTACAAATGCGTATGAAACAGGCAAAAAATTTCACAATAACCTTGATTGGCTGGACAATTAAAACGAGCTTTTTCGCGGTAAGTGGATTGGTACTTTTATGGTTATTTCACTTTATACCGGATTTTATGCAATTGGGACCGGGCTTTGATTTAATTGGACTTCCACAATTCGGTGGTCGCTGGAtgatga < 1:705194/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |