| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 74,205 | A→G | T93A (ACC→GCC) | unknown → | Type IV pilus biogenesis protein PilF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 74,205 | 0 | A | G | 100.0% | 224.5 / NA | 78 | T93A (ACC→GCC) | unknown | Type IV pilus biogenesis protein PilF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (45/33); total (45/33) | |||||||||||
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acaacaGGGCGACATTGAACAAGCCCGCACCGCCTATTTGAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCat < 1:336606/251‑1 (MQ=255) caacaGGGCGACATTGAACAAGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCatt > 1:27176/1‑251 (MQ=255) aCATTGAACAAGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCATTATTGACGaaa > 1:53610/1‑251 (MQ=255) cATTGAACAAGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑TGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCa > 1:581446/1‑159 (MQ=255) aTTGAACAAGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCATTATTGACGAAAAt < 1:27881/251‑1 (MQ=255) gAACAAGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGaaa > 1:285897/1‑175 (MQ=255) gAACAAGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCg < 1:501496/183‑1 (MQ=255) gAACAAGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCATTATTGACGAAAAtct > 1:842013/1‑250 (MQ=255) gAACAAGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCATTATTGACGAAAAtct > 1:200891/1‑250 (MQ=255) gAACAAGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCATTATTGACGAAAAtct > 1:701632/1‑250 (MQ=255) aGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCATTATTGACGAAAAtc > 1:295642/1‑244 (MQ=255) aGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCATTATTGACGAAAATCTCTCCGa > 1:859367/1‑251 (MQ=255) aGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCATTATTGACGAAAATCTCTCCGa > 1:50579/1‑251 (MQ=255) aGCCCGCACCGCCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCATTATTGACGAAAATCTCTCCGa > 1:116800/1‑251 (MQ=255) | TATTTTTCCGTTTTTGCTTTCCGCCTGCGTCACCCAACAAAGTGCGGTGGATTTTGACAAGCAAAAAGCCGCCAAAGCACGCGTGGAACTGGCATTAGGCTATTTACAGCAGCAAGATTCGGCACAAGCCAAGCTGAACCTGGATAAAGCCTTTTCTTACGCTCCCGATTATTATTTAGTGTCAGCGGCATTTGCCTATTTCTATCAACAACAGGGCGACATTGAACAAGCCCGTACCACCTATTTAAACGCGATAAAATTAGATGATAAACAA‑GGGGATGTGTTCAATAATTACGGTGCATTTCTTTGTGCGCAAGGGGAATTCGACAGTGCCTATGTACAATTTGAACGCGCCTTAAAAAGCTCGAATTATTACCATCAGGCGGACACTTATGAAAACTTGGCGTTATGTGCTTTATCCGCCAAAAATCAGGCGATTTATCGGCAAAATCTCGCATTATTGACGAAAATCTCTCCGA > 1/73967‑74445 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |