| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 210,519 | A→G | R334R (CGT→CGC) | unknown ← | 8‑amino‑7‑oxononanoate synthase (EC 2.3.1.47) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 210,519 | 0 | A | G | 100.0% | 281.5 / NA | 97 | R334R (CGT→CGC) | unknown | 8‑amino‑7‑oxononanoate synthase (EC 2.3.1.47) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (53/44); total (53/44) | |||||||||||
TTGGATGACCAATGGTGTCATACCCCATCCGGTGAAATACACGATTAAATGCCGACGTGTCAGGTTTACGTTAATTAATTGATATTGCATAAAATAACTGTTCTATAAATTGTTCAATTTCATCATGGGTCATATCGGCTGTTAAAGACAAACGAATGCGAGATGTTCCGACAGGAACGGTAGGCGGCCGAATAGGTAAGCAATAATATCCACATTGTTGAAGGCGGTGCGCTATTTTTATAGTACGCTGATTTTCGCCTAAAATATAAGGTACTATATGGCTTTCACTTGGCATTGGCATATTGAATTGCTCTGCGAGAACCTGCCGTAATCGCGCACTTAATTGCATGAGATGTTGTCGTTTAGCCTGAAAGTGCGGTTGTTTTTCGAAGAGAAATGTGGTCCATGCCACATTGAATGGCGGTAACGCTGTGCTGAAGATCAAAGGGCGCATAGTGTTAATTAAATAATCTTTAATGACTCG > 1/210275‑210758 | ttGGATGACCAATGGTGTCATACCCCATCCGGTGAAATACACGATTAAATGCCGACGTGTCAGGTTTACGTTAATTAATTGATATTGCATAAAATAACTGTTCTATAAATTGTTCAATTTCATCATGGGTCATATCGGCTGTTAAAGACAAACGAATGCGAGATGTTCCGACAGGAACGGTAGGCGGCCGAATAGGTAAGCAATAATATCCACATTGTTGAAGGCGGTGCGCTATTTTTATAGTGCGCTGa > 1:859410/1‑251 (MQ=255) 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tatCCACATTGTTGAAGGCGGTGCGCTATTTTTATAGTGCGTTGATTTTCGCCTAAAATATAAGGTACTATATGGCTTTCACTTGGCATTGGCATATTGAATTGCTCTGCGAGAACCTGCCGTAATCGCGCACTTAATTGCATGAGATGTTGTCGTTTAGCCTGAAAGTGCGGTTGTTTTTCGAAGAGAAATGTGGTCCATGCCACATTGAATGGCGGTAACGCTGTGCTGAAGATCAAAGGGCGCATAgt < 1:101909/251‑1 (MQ=255) atCCACATTGTTGAAGGCGGTGCGCTATTTTTATAGTGCGCTGATTTTCGCCTAAAATATAAGGTACTATATGGCTTTCACTTGGCATTGGCATATTGAATTGCTCTGCGAGAACCTGCCGTAATCGCGCACTTAATTGCATGAGATGTTGTCGTTTAGCCTGAAAGTGCGGTTGTTTTTCGAAGAGAAATGTGGTCCATGCCACATTGAATGGCGGTAACGCTGTGCTGAAGATCAAAGGGCGCATAg > 1:824187/1‑249 (MQ=255) acaTTGTTGAAGGCGGTGCGCTATTTTTATAGTGCGCTGATTTTCGCCTAAAATATAAGGTACTATATGGCTTTCACTTGGCATTGGCATATTGAATTGCTCTGCGAGAAcc < 1:245972/112‑1 (MQ=255) acaTTGTTGAAGGCGGTGCGCTATTTTTATAGTGCGCTGATTTTCGCCTAAAATATAAGGTACTATATGGCTTTCACTTGGCATTGGCATATTGAATTGCTCTGCGAGAACCTGCCGTAATCGCGCACTTAATTGCATGAGATGTTGTCGTTTAGCCTGAAAGTGCGGTTGTTTTTCGAAGAGAAATGTGGTCCATGCCACATTGAATGGCGGTAACGCTGTGCTGAAGATCAAAGGGCGCATAGTGttaa > 1:15649/1‑251 (MQ=255) 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cTATTTTTATAGTGCGCTGATTTTCGCCTAAAATATAAGGTACTATATGGCTTTCACTTGGCATTGGCATATTGAATTGCTCTGCGAGAACCTGCCGTAATCGCGCACTTAATTGCATGAGATGTTGTCGTTTAGCCTGAAAGTGCGGTTGTTTTTCGAAGAGAAATGTGGTCCATGCCACATTGAATGGCGGTAACGc > 1:773918/1‑199 (MQ=255) cTATTTTTATAGTGCGCTGATTTTCGCCTAAAATATAAGGTACTATATGGCTTTCACTTGGCATTGGCATATTGAATTGCTCTGCGAGAACCTGCCGTAATCGCGCACTTAATTGCATGAGATGTTGTCGTTTAGCCTGAAAGTGCGGTTGTTTTTCGAAGAGAAATGTGGTCCATGCCACATTGAATGGCGGTAACGCTGTGCTGAAGATCAAAGGGCGCATAGTGttaatt > 1:163865/1‑233 (MQ=255) cTATTTTTATAGTGCGCTGATTTTCGCCTAAAATATAAGGTACTATATGGCTTTCACTTGGCATTGGCATATTGAATTGCTCTGCGAGAACCTGCCGTAATCGCGCACTTAATTGCATGAGATGTTGTCGTTTAGCCTGAAAGTGCGGTTGTTTTTCGAAGAGAAATGTGGTCCATGCCACATTGAATGGCGGTAACGCTGTGCTGAAGATCAAAGGGCGCATAGTGTTAATTAAATAATCTTTAATGACt < 1:598725/251‑1 (MQ=255) 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tttttATAGTGCGCTGATTTTCGCCTAAAATATAAGGTACTATATGGCTTTCACTTGGCATTGGCATATTGAATTGCTCTGCGAGAACCTGCCGTAATCGCGCACTTAATTGCATGAGATGTTGCCGTTTAGCCTGAAAGTGCGGTTGTTTTTCGAAGAGAAATGTGGTCCATGCCACATTGAATgg > 1:619851/1‑187 (MQ=255) | TTGGATGACCAATGGTGTCATACCCCATCCGGTGAAATACACGATTAAATGCCGACGTGTCAGGTTTACGTTAATTAATTGATATTGCATAAAATAACTGTTCTATAAATTGTTCAATTTCATCATGGGTCATATCGGCTGTTAAAGACAAACGAATGCGAGATGTTCCGACAGGAACGGTAGGCGGCCGAATAGGTAAGCAATAATATCCACATTGTTGAAGGCGGTGCGCTATTTTTATAGTACGCTGATTTTCGCCTAAAATATAAGGTACTATATGGCTTTCACTTGGCATTGGCATATTGAATTGCTCTGCGAGAACCTGCCGTAATCGCGCACTTAATTGCATGAGATGTTGTCGTTTAGCCTGAAAGTGCGGTTGTTTTTCGAAGAGAAATGTGGTCCATGCCACATTGAATGGCGGTAACGCTGTGCTGAAGATCAAAGGGCGCATAGTGTTAATTAAATAATCTTTAATGACTCG > 1/210275‑210758 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |