| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 165,909 | C→T | D21D (GAC→GAT) | unknown → | Argininosuccinate lyase (EC 4.3.2.1) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 165,909 | 0 | C | T | 100.0% | 245.6 / NA | 87 | D21D (GAC→GAT) | unknown | Argininosuccinate lyase (EC 4.3.2.1) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (41/46); total (41/46) | |||||||||||
CGAATATTTTCAATATATGGATAAAAAACGCGGCAAATGGATTCACGCGAAAAACGAAGATTTATTAAAATAACCGTCAATTAAGCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAGCAGATTTTTGTTGATCGCCTTTTTTGTTTCTGTGATATATTTTTTAACCGATTTCACAAATAACAATCAGAGGGTTCTATGGCACTTTGGGGTGGACGCTTCACGCAAGCTGCGGATAAGCGTTTTAAAAACTTTAACGACTCATTACGCTTTGACTACCGTTTGGCAGAGCAAGACATCGAAGGCTCAATCGGCTGGTCGAAAGCGTTGGTATCCGTGGGCATTTTAGATGTGCAGGAACAACAACAATTAGAACAGGCATTGCACGAATTATTAGTTGAAGTGCGGTCAAATCCGCAAGCGATTTTACAAGATGACGCGGAAGACATCCACAGCTGGGTGGAAAGTAAGCTCATTGATAAGGTAGGCAATT > 1/165662‑166141 | cGAATATTTTCAATATATGGATAAAAAACGCGGCAAATGGATTCACGCGAAAAACGAAGATTTATTAAAATAACCGTCAATTAAGCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAGCAGATTTTTGTTGATCGCCTTTTTTGTTTCTGTGATATATTTTTTAACCGATTTCACAAATACCAATCAGAGGGTTCTATGGCACTTTGGGGTGGACGCTTCACGCAAGCTGCGGATAAGCGTTTTAAAAACTTTAACGATTCa > 1:455376/1‑251 (MQ=255) 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CGAATATTTTCAATATATGGATAAAAAACGCGGCAAATGGATTCACGCGAAAAACGAAGATTTATTAAAATAACCGTCAATTAAGCAAAAAGTGCGGTCACAAAAAGCAGATTTTTGTTGATCGCCTTTTTTGTTTCTGTGATATATTTTTTAACCGATTTCACAAATAACAATCAGAGGGTTCTATGGCACTTTGGGGTGGACGCTTCACGCAAGCTGCGGATAAGCGTTTTAAAAACTTTAACGACTCATTACGCTTTGACTACCGTTTGGCAGAGCAAGACATCGAAGGCTCAATCGGCTGGTCGAAAGCGTTGGTATCCGTGGGCATTTTAGATGTGCAGGAACAACAACAATTAGAACAGGCATTGCACGAATTATTAGTTGAAGTGCGGTCAAATCCGCAAGCGATTTTACAAGATGACGCGGAAGACATCCACAGCTGGGTGGAAAGTAAGCTCATTGATAAGGTAGGCAATT > 1/165662‑166141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |