| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 2,036,360 | G→A | A37T (GCC→ACC) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,036,360 | 0 | G | A | 100.0% | 251.3 / NA | 88 | A37T (GCC→ACC) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (43/45); total (43/45) | |||||||||||
TAAAGTAAAATTTGAAGTAAAAGGCGAAAAAAGCCGTAAATACGTAAGTATCGTTACTGAGTAATTTTACCAAAACAGAATAAAATGCCCTGCTTTCATGCAGGGCTTTTTTATAGGTGAAATTTAGGTGGAATCATGCAACAACAACCTTTAGCCGGTTTTTTACTCGCGTTAACCGCCGTCTGTATGTGGGGTGCGTTGCCTATCGCCTTGCAACAGATCGTCGCAGTCATGGATGCCCAAGCCATTGTGTGGTATCGCTTTATCACATCGGCGATCGGTTTATTTATTTTATTGGGATTACGTAAAACGCTGCCAAAACCCACCGCACTTCGTCAGCGTTATCTCCTTTTGATTATGCTGGGCATTCTTGGGCTATCGGCAAATTTCTTCTTATTTAATCTGGCGCTGAACTATATTCCACCGACCAGCAGCCAAGTGCTCAGTCCGTTATCCTCGTTTATCATGCTATTTGTCGGTGTGTTTGT > 1/2036117‑2036604 | taaagtaaaATTTGAAGTAAAAGGCGAAAAAAGCCGTAAATACGTAAGTATCGTTACTGAGTAATTTTACCAAAACAGAATAAAATGCCCTGCTTTCATGCAGGGCTTTTTTATAGGTGAAATTTAGGTGGAATCATGCAACAACAACCTTTAGCCGGTTTTTTACTCGCGTTAACCGCCGTCTGTATGTGGGGTGCGTTGCCTATCGCCTTGCAACAGATCGTCGCAGTCATGGATGCCCAAACCATtg < 1:56294/250‑1 (MQ=255) 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tCATGGATGCCCAAACCATTGTGTGGTATCGCTTTATCACATCGGCGATCGGTTTATTTATTTTATTGGGATTACGTAAAACGCTGCCAAAACCCACCGCACTTCGTCAGCGTTATCTCCTTTTGATTATGCTGGGCATTCTTGGGCTATCGGCAAATTTCTTCTTATTTAATCTGGCGCTGAACTATATTCCACCGACCAGCAGCCAAGTGCTCAGTCCGTTATCCTCGTTTATCATGCTATTTGTc < 1:615275/248‑1 (MQ=255) tCATGGATGCCCAAACCATTGTGTGGTATCGCTTTATCACATCGGCGATCGGTTTATTTATTTTATTGGGATTACGTAAAACGCTGCCAAAACCCACCGCACTTCGTCAGCGTTATCTCCTTTTGATTATGCTGGGCATTCTTGGGCTATCGGCAAATTTCTTCTTATTTAATCTGGCGCTGAACTATATTCCACCGACCAGCAGCCAAGTGCTCAGTCCGTTATCCTCGTTTATCATGCTATTTGTc < 1:95873/248‑1 (MQ=255) cATGGATGCCCAAACCATTGTGTGGTATCGCTTTATCACATCGGCGATCGGTTTATTTATTTTATTGGGATTACGTAAAACg < 1:84178/82‑1 (MQ=255) aTGGATGCCCAAACCATTGTGTGGTATCGCTTTATCACATCGGCGATCGGTTTATTTATTTTATTGGGATTACGTAAAACGCTGCCAAAACCCACCGCACTTCGTCAGCGTTATCTCCTTTTGATTATGCTGGGCATTCTTGGGCTATCGGCAAATTTCTTCTTATTTAATCTGGCGCTGAACTATATTCCACCGACCAGCAGCCAAGTGCTCAGTCCGTTATCCTCGTTTATCATGCTATTTGTCGgtgt > 1:208178/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |