| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,025,356 | A→C | N4H (AAT→CAT) | unknown → | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,025,356 | 0 | A | C | 100.0% | 257.3 / NA | 85 | N4H (AAT→CAT) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (51/34); total (51/34) | |||||||||||
AAATAAAATAAAATAATCTTTAAAAATAGTTCATAGCATACTATCAAAATCACATCAGACCAGTTAGTTAGGGAACTTTTTGACCAAAAGTTCACGTTGTTTTTCCGCTTTAATAACAGTCGGTTAACAAACGACGTTAAAATTAGCAACAATTATCATTTGCAAACAGAATCCAAATAAGCTAAATTGCCCCGCGATAAATTTCATACTTTTATTAACCCTTACAGGAGCATTTATGCGTAAAAATTTTTCATTGCTTCCTCTGGCAATATTAGTTGCCACCGCAGTTCAGGCTGAGGAATTAGATATCATCAATGTGGTGTCCGAAAATACCGGTGCCAAAAGCAAAACCAATGTAATTACTACAGAATCAGTTAATCGCAGTACTGAAACCGAGTTAAAAGGTTTACTCAAGGAAGAGCCCGCACTTAACTTCGGGGGAGGGCGCGGAACCTCTCAATGGTTTACCATTCGTGGTATGGGACAGGATC > 1/2025112‑2025602 | aaataaaataaaataATCTTTAAAAATAGTTCATAGCATACTATCAAAATCACATCAGACCAGTTAGTTAGGGAACTTTTTGACCAAAAGTTCACGTTGTTTTTCCGCTTTAATAACAGTCGGTTAACAAACGACGTTAAAATTAGCAACAATTATCATTTGCAAACAGAATCCAAATAAGCTAAATTGCCCCGCGATAAATTTCATACTTTTATTAACCCTTACAGGAGCATTTATGCGTAAACAttttt > 1:689043/1‑251 (MQ=255) 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ttattaACCCTTACAGGAGCATTTATGCGTAAACATTTTTCATTGCTTCCTCTGGCAATATTAGTTGCCACCGCAGTTCAGGCTGAGGAATTAGat < 1:800125/96‑1 (MQ=255) ttattaACCCTTACAGGAGCATTTATGCGTAAACATTTTTCATTGCTTCCTCTGGCAATATTAGTTGCCACCGCAGTTCAGGCTGAGGAATTAGATATCATCAATGTGGTGTCCGAAAATACCGGTGCCAAAAGCAAAACCAATGTAATTACTACAGAATCAGTTAATCGCAGTACTGAAACCGAGTTAAAAGGTTTACTCAAGGAAGAGCCCGCACTTAACTTCGGGGGAGGGCGCGGAACCTCTCAATg > 1:529606/1‑251 (MQ=255) tattaACCCTTACAGGAGCATTTATGCGTAAACATTTTTCATTGCTTCCTCTGGCAATATTAGTTGCCACCGCAGTTCAGGCTGAGGAATTAGATATCATCAATGTGGTGTCCGaa > 1:402158/1‑116 (MQ=255) tattaACCCTTACAGGAGCATTTATGCGTAAACATTTTTCATTGCTTCCTCTGGCAATATTAGTTGCCACCGCAGTTCAGGCTGAGGAATTAGATATCATCAATGTGGTGTCCGAAAATACCGGTGCCAAAAGCAAAACCAATGTAATTACTACAGAATCAGTTAATCGCAGTACTGAAACCGAg > 1:149039/1‑185 (MQ=255) 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(MQ=255) cccTTACAGGAGCATTTATGCGTAAACATTTTTCATTGCTTCCTCTGGCAATATTAGTTGCCACCGCAGTTCAGGCTGAGGAATTAGATATCATCAATGTGGTGTCCGAAAATACCGGTGCCAAAAGCAAAACCAATGTAATTACTACAGAATCAGTTAATCGCAGTACTGAAACCGAGTTAAAAGGTTTACTCAAGGAAGAGCCCGCACTTAACTTCGGGGGAGGGCGCGGAACCTCTCAATGGTTTAc > 1:343715/1‑250 (MQ=255) cccTTACAGGAGCATTTATGCGTAAACATTTTTCATTGCTTCCTCTGGCAATATTAGTTGCCACCGCAGTTCAGGCTGAGGAATTAGATATCATCAATGTGGTGTCCGAAAATACCGGTGCCAAAAGCAAAACCAATGTAATTACTACAGAATCAGTTAATCGCAGTACTGAAACCGAGTTAAAAGGTTTACTCAAGGAAGAGCCCGCACTTAACTTCGGGGGAGGGCGCGGAACCTCTCAATGGTTTAc > 1:21973/1‑250 (MQ=255) ccTTACAGGAGCATTTATGCGTAAACATTTTTCATTGCTTCCTCTGGCAATATTAGTTGCCGCCGCAGTTCAGGCTGAGGAATTAGATATCATCAATGTGGTGTCCGAAAATACCGGTGCCAAAAGCAAAACCAATGTAATTACTACAGAATCAGTTAATCGCAGTACTGAAACCGAGTTAAAAgg < 1:539381/186‑1 (MQ=255) ttACAGGAGCATTTATGCGTAAACATTTTTCATTGCTTCCTCTGGCAATATTAGTTGCCACCGCAGTTCAGGCTGAGGAATTAGATATCATCAATGTGGTGTCCGAAAATACCGGTGCCAAAAGCAAAACCAATGTAATTACTACAGAATCAGTTAATCGCAGTACTGaaa < 1:188866/171‑1 (MQ=255) 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AAATAAAATAAAATAATCTTTAAAAATAGTTCATAGCATACTATCAAAATCACATCAGACCAGTTAGTTAGGGAACTTTTTGACCAAAAGTTCACGTTGTTTTTCCGCTTTAATAACAGTCGGTTAACAAACGACGTTAAAATTAGCAACAATTATCATTTGCAAACAGAATCCAAATAAGCTAAATTGCCCCGCGATAAATTTCATACTTTTATTAACCCTTACAGGAGCATTTATGCGTAAAAATTTTTCATTGCTTCCTCTGGCAATATTAGTTGCCACCGCAGTTCAGGCTGAGGAATTAGATATCATCAATGTGGTGTCCGAAAATACCGGTGCCAAAAGCAAAACCAATGTAATTACTACAGAATCAGTTAATCGCAGTACTGAAACCGAGTTAAAAGGTTTACTCAAGGAAGAGCCCGCACTTAACTTCGGGGGAGGGCGCGGAACCTCTCAATGGTTTACCATTCGTGGTATGGGACAGGATC > 1/2025112‑2025602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |