| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 101,620 | T→C | A273A (GCA→GCG) | unknown ← | DNA transposition protein Mup03, A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 101,620 | 0 | T | C | 100.0% | 284.4 / NA | 98 | A273A (GCA→GCG) | unknown | DNA transposition protein Mup03, A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (46/52); total (46/52) | |||||||||||
ATAAGCCCGCTTTCATACAGCGCTTTATATTTAGGCATCCATTCGCGATACCGTACTTATTCACGACATCAAGCAACGCCAAGCGGATCATGTTGGTGTTTTCCGACTCATCGCACCGATACGCCAAGATTTTGCGGGTGCGCACATCCTGCCAAAGCCACGTTTTAGGGCGGATAATGTGGCCGTTATGCCATCTCACCCAAACGTTATGCTTATAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATTGCTTCAATGCCGGCAACGGTACGAATGAGCGATGGATACATGCGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTCGCACTTGCCGCACGTTTCAAGCGTTCATAACAAGATCCAAACTGAGGGCGCTCATTACGGAAATAGTCGGCGCGGAAAAATGCCCAAGCTT > 1/101379‑101861 | ttaactggagaggtaaattcaaaggcatcataatactcgtcttttttgattgtggttcttctttcatttgttaagtttactgcattcttgatgatatctttgccgcttactattgtcatcacagttgcattgacgggacccacgccttccttcaatatgcgcaccgccgatacccaagccgcttttgctctcaaaaatgatgatttttctgccgttaaCCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATg < 1:462916‑M2/33‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |