| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,967,829 | T→C | A440A (GCA→GCG) | unknown ← | Inositol transport system ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,967,829 | 0 | T | C | 100.0% | 233.3 / NA | 80 | A440A (GCA→GCG) | unknown | Inositol transport system ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (45/35); total (45/35) | |||||||||||
CGTTTTCCATAATAAACCTCTCATTTTCTAATTAAAAACCGACCCTGATAAATAAAAAAATTAGCCTGAAGCCAATTCAAGAATGCGTTCTTGTGTCAGATCCGTATGAGGAATAATACCCACTTGATATCCTTCATGCATTACCATCACGCGGTCACTCATCGATAAAAGCTCCAACATATCCGACGTAATCATAATGATGGTTTTGCCCTGTTTTGATAGCTCAACCATTAGTTTATACAATTCTGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGCTTTGTTTTTTGTTCATTTGCTGTTCTTTTTGCTCTGACGACAGACACCAGGAAATTTTCCAGATATGGCGACATTTTCGGCATAATCATGTTG > 1/1967583‑1968075 | cGTTTTCCATAATAAACCTCTCATTTTCTAATTAAAAACCGACCCTGATAAATAAAAAAATTAGCCTGAAGCCAATTCAAGAATGCGTTCTTGTGTCAGATCCGTATGAGGAATAATACCCACTTGATATCCTTCATGCATTACCATCACGCGGTCACTCATCGATAAAAGCTCCAACATATCCGACGTAATCATAATGATGGTTTTGCCCTGTTTTGATAGCTCAACCATTAGTTTATACAATTCCGCtt > 1:118214/1‑251 (MQ=255) 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aGTTTATACAATTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGcc > 1:528506/1‑85 (MQ=255) aGTTTATACAATTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGc > 1:244935/1‑168 (MQ=255) aGTTTATACAATTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGCTTTGTTTTTTGTTCATTTGCTGTTCTTTTTGCTCTGACGACAGACACCAGGAAATTTTCCAGATATGGCGACATTTTCGGc > 1:244057/1‑249 (MQ=255) aGTTTATACAATTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGCTTTGTTTTTTGTTCATTTGCTGTTCTTTTTGCTCTGACGACAGACACCAGGAAATTTTCCAGATATGGCGACATTTTCGGCAt > 1:141381/1‑251 (MQ=255) 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ttATACAATTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGCTTTGTTTTTTGTTCATTTGCTGCTCTTTTTGCTCTGACGACAGACACCAGGAAATTTTCCAGATATGGCGACATTTTCGGCATAAt < 1:574906/251‑1 (MQ=255) ataCAATTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACAt > 1:874534/1‑143 (MQ=255) ataCAATTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGCTTTGTTTTTTGTTCATTTGCTGTTCTTTTTGCTCTGACGACAGACACCAGGAAATTTTCCAGATATGGCGACATTTTCGGCATAATCa > 1:443070/1‑251 (MQ=255) ataCAATTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGCTTTGTTTTTTGTTCATTTGCTGTTCTTTTTGCTCTGACGACAGACACCAGGAAATTTTCCAGATATGGCGACATTTTCGGCATAATCa < 1:325595/251‑1 (MQ=255) ataCAATTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGCTTTGTTTTTTGTTCATTTGCTGTTCTTTTTGCTCTGACGACAGACACCAGGAAATTTTCCAGATATGGCGACATTTTCGGCATAATCa < 1:744372/251‑1 (MQ=255) aTTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGAttgttt > 1:225709/1‑122 (MQ=255) aTTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGCTTTGTTTTTTGTTCATTTGCTGTTCTTTTTGCTCTGACGACAGACACCAGGAAATTTTCCAGATATGGCGACATTTTCGGCATAATCAtgttg < 1:154514/251‑1 (MQ=255) aTTCCGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGCTTTGTTTTTTGTTCATTTGCTGTTCTTTTTGCTCTGACGACAGACACCAGGAAATTTTCCAGATATGGCGACATTTTCGGCATAATCAtgttg > 1:560513/1‑251 (MQ=255) | CGTTTTCCATAATAAACCTCTCATTTTCTAATTAAAAACCGACCCTGATAAATAAAAAAATTAGCCTGAAGCCAATTCAAGAATGCGTTCTTGTGTCAGATCCGTATGAGGAATAATACCCACTTGATATCCTTCATGCATTACCATCACGCGGTCACTCATCGATAAAAGCTCCAACATATCCGACGTAATCATAATGATGGTTTTGCCCTGTTTTGATAGCTCAACCATTAGTTTATACAATTCTGCTTTTGCCCCCACATCAATCCCTTTTGTCGGTTCATCCAAAATCAGAATGTCCGGCTCTAACAATAGCCAGCGGGCAAGTAAGACTTTTTGCTGATTTCCCCCTGAAAGATTGTTTGTAATCACTTCCACATTCGGGGCTTTTATCTTGAGCTTTGTTTTTTGTTCATTTGCTGTTCTTTTTGCTCTGACGACAGACACCAGGAAATTTTCCAGATATGGCGACATTTTCGGCATAATCATGTTG > 1/1967583‑1968075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |