| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,813,382 | T→C | L110L (TTA→TTG) | unknown ← | D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose 1‑phosphate adenylyltransferase (EC 2.7.7.70) / D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑7‑phosphate kinase (EC 2.7.1.167) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,813,382 | 0 | T | C | 100.0% | 166.4 / NA | 57 | L110L (TTA→TTG) | unknown | D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose 1‑phosphate adenylyltransferase (EC 2.7.7.70) / D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑7‑phosphate kinase (EC 2.7.1.167) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (28/29); total (28/29) | |||||||||||
TAATAAGGTCGCACCGCGATAGCGTTCAAAATCCGTCCCTTTCGGATCGATGAGCACCGGCACATTGGCGTTACGGGCAATTTGGATCATTTTTTGTACTTCATTTAATGTGCCTTTGCCGTAATCGGACAAGATCAAAGCGCCGTAATTTTTGACCGCACTTTCTAGTTTTTTCAGCAAATCCGCACTTGTCATGTTCTGGAAATCTTCTTCAAAATCAAGGCGTAATAATTGTTGATGGCGGGATAAAATACGCAATTTGGTAATTGTCGGGTGGGTAGCAAGCTGTACGAAGTCGCAAGCGATTTTTTGTTGTTGTAATAATGAGGTTAACGCCGCGCCCGCTTCATCCTGACCGGTTAAGCCCAGCAATTGCACCGGCACATTTAACGAAGCGATGTTCATTGCCACGTTTGCCGCACCGCCTGCACGCTCCTCATTTTGCTGAACACGCACCACCGGCACCGGTGCTTCCGGTGAAATA > 1/1813136‑1813619 | taataaGGTCGCACCGCGATAGCGTTCAAAATCCGTCCCTTTCTGATCGATGATCACCGGCACATTGGCGTTACGGGCAATTTTTATCATTTTTTGTACTTCATTTATTGTGCCTTTGCCGTAATCGGACAAGTTCAAAGCGCCGTAATTTTTGACCGCACTTTCTAGTTTTTTCAGCAAATCCGCACTTGTCACGTTCTGGAAATCTTCTTCAAAATCAAGGCGTAATAATTGTTGATGTCGGGACaaaa > 1:550778/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |