| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,648,808 | A→C | L64R (CTA→CGA) | unknown ← | TRAP‑type C4‑dicarboxylate transport system, periplasmic component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,648,808 | 0 | A | C | 100.0% | 256.3 / NA | 85 | L64R (CTA→CGA) | unknown | TRAP‑type C4‑dicarboxylate transport system, periplasmic component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (35/50); total (35/50) | |||||||||||
TAATAAGTCAACCCAATGAAACCTTTGCCCTTTGATGAATCAAGAATTTTTTGCCCAACTTCAGGATCAAGTAGAGCACGATAATAATGATCAACATTATGGAAAAGATACGGAATATTGTATGCACCATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTAGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGTTTTGTCATTATTATGACTTAATTTTAGTACGGTTTTAGCAGAAGCTGAGAACGCCATCCCAGCTGATAACGCCAAGACCAATGCATAAGAAAAAACATTTTTTTTGATTTGCATAACGCATCTCCCATAGTAAGTAAATTAAAGAACAACCCTCTAACAACTAGGAGGT > 1/1648562‑1649053 | taataaGTCAACCCAATGAAACCTTTGCCCTTTGATGAATCAAGAATTTTTTGCCCAACTTCAGGATCAAGTAGAGCACGATAATAATGATCAACATTATGGAAAAGATACGGAATATTGTATGCACCATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTCGGAt > 1:126440/1‑251 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TAATAAGTCAACCCAATGAAACCTTTGCCCTTTGATGAATCAAGAATTTTTTGCCCAACTTCAGGATCAAGTAGAGCACGATAATAATGATCAACATTATGGAAAAGATACGGAATATTGTATGCACCATAAGATGGCTCAAATGCTTCTAATTCACTTGCGTTTGATTTTGCCATATCTAGTGACCCGGATTGCAATAATTCCATTGATTCACGCTGGCTACCAAGCTGGCTATTTGGGTAAATTAGGATCACCACTTCACCATTTGTTAATTTTTTAACTTCATCTGCCATATATTGCATCGAAATATGCACAGGGTGAGTTTTGTCATTATTATGACTTAATTTTAGTACGGTTTTAGCAGAAGCTGAGAACGCCATCCCAGCTGATAACGCCAAGACCAATGCATAAGAAAAAACATTTTTTTTGATTTGCATAACGCATCTCCCATAGTAAGTAAATTAAAGAACAACCCTCTAACAACTAGGAGGT > 1/1648562‑1649053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |