| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,647,331 | G→A | D224D (GAC→GAT) | unknown ← | 2‑dehydro‑3‑deoxygluconokinase (EC 2.7.1.45) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,647,331 | 0 | G | A | 100.0% | 163.7 / NA | 58 | D224D (GAC→GAT) | unknown | 2‑dehydro‑3‑deoxygluconokinase (EC 2.7.1.45) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (27/31); total (27/31) | |||||||||||
CGACATAATTGCCTTGTCGGCAGCAAATGTCTAAAGGTTTATTTCGTAAATAACCATTCAAAAAGCCGGCATTAAAAGAATCTCCTGCTGATGTGGTGTCAACAACATTTGAAATAGGTTTCGGCACAACTTGTCCATATTGAGAAGTTTGAGAATCTGAAAAAATCGCACCATTTCGACCGCACTTTACAACTACTTTTGGTATGCCAATTTGATGTAAGCGCGTTAGCGTGGCCGGTTCATTTGTGTCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCAGAGTTTAGGTCTAAAATTACTATCAAAAGAGATTTGCACGCCTTTTTTAGCTAATTTTATAAGCTGTTCAAGCAAAAAAGTGCGGTCATTTTTAGGTAAGATCGCAAGTGAAATGCCACTCAAGTAAATCATATCCACTTGT > 1/1647084‑1647574 | cgACATAATTGCCTTGTCGGCAGCAAATGTCTAAAGGTTTATTTCGTAAATAACCATTCAAAAAGCCGGCATTAAAAGAACCTCCTGCTGATGTGGTGTCAACAACATTTGAAATAGGTTTCGGCACAACTTGTCCATATTGAGAAGTTTGAGAATCTGAAAAAATCGCACCATTTCGACCGCACTTTACAACTACTTTTGGTATGCCAATTTGATGTAAGCGCGTTAGCGTGGCCGGTTCATTTGTATCg < 1:244728/251‑1 (MQ=255) 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1:100053/221‑1 (MQ=255) gAAATAGGTTTCGGCACAACTTGTCCATATTGAGAAGTTTGAGAATCTGAAAAAATCGCACCATTTCGACCGCACTTTACAACTACTTTTGGTATGCCAATTTGATGTAAGCGCGTTAGCGTGGCCGGTTCATTTGTATCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCagag > 1:457791/1‑242 (MQ=255) gAAATAGGTTTCGGCACAACTTGTCCATATTGAGAAGTTTGAGAATCTGAAAAAATCGCACCATTTCGACCGCACTTTACAACTACTTTTGGTATGCCAATTTGATGTAAGCGCGTTAGCGTGGCCGGTTCATTTGTAACGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCAGAGTTTAGGt > 1:589105/1‑249 (MQ=255) tAGGTTTCGGCACAACTTGTCCATATTGAGAAGTTTGAGAATCTGAAAAAATCGCACCATTTCGACCGCACTTTACAACTACTTTTGGTATGCCAATTTGATGTAAGCGCGTTAGCGTGGCCGGTTCATTTGTATCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCAGAGTTTAGGTCTaaaa < 1:402283/251‑1 (MQ=255) cTTGTCCATATTGAGAAGTTTGAGAATCTGAAAAAATCGCACCATTTCGACCGCACTTTACAACTACTTTTGGTATGCCAATTTGATGTAAGCGCGTTAGCGTGGCCGGTTCATTTGTATCGTTCCACAATAATTGCtc < 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(MQ=255) gTTTGAGAATCTGAAAAAATCGCACCATTTCGACCGCACTTTACAACTACTTTTGGTATGCCAATTTGATGTAAGCGCGTTAGCGTGGCCGGTTCATTTGTATCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTg > 1:397715/1‑182 (MQ=255) gAAAAAATCGCACCATTTCGACCGCACTTTACAACTACTTTTGGTATGCCAATTTGATGTAAGCGCGTTAGCGTGGCCGGTTCATTTGTATCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCAGAGTTTAGGTCTAAAATTACTATCAAAAGAGATTTGCACGCCTTTTTTAGCTAATTTtat > 1:483564/1‑251 (MQ=255) ccATTTCGACCGCACTTTACAACTACTTTTGGTATGCCAATTTGATGTAAGCGCGTTAGCGTGGCCGGTTCATTTGTATCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCAGAGTTTAGGTCTAAAATTACTATCAAAAGAGATTTGCACGCCtttttt > 1:111263/1‑227 (MQ=255) 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ggCCGGTTCATTTGTATCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCAGAGTTTAGGTCTAAAATTACTATCAAAAGAGATTTGCACGCCTTTTTTAGCTAATTTTATAAGCTGTTCAAGCAAAAAAGTGCGGTCATTTTTAGGTAAGATCGCAAGTGAAATGCCACTCAAGTAAATCatat > 1:102979/1‑251 (MQ=255) gTTCATTTGTATCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCAGAGTTTAGGTCTAAAAt < 1:84092/129‑1 (MQ=255) gTTCATTTGTATCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCAGAGTTTAGGTCTAAAATTACTATCAAAAGAGATTTGCACGCCTTTTTTAGCTAATTTTATAAGCTGTTCAAGCAAAAAAGTGCGGTCATTTTTAGGTAAGATc > 1:594244/1‑215 (MQ=255) cATTTGTATCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCAGAGTTTAGGTCTAAAATTACTATCAAAAGAGATTTGCACGCCTTTTTTAGCTAATTTTATGAGCTGTTCAAGCAAAAAAGTGCGGTCATTTTTAGGTAAGATCGCAAGTGAAATGCCACTCAAGTAAATCATATCCACTTGt > 1:439165/1‑251 (MQ=255) 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CGACATAATTGCCTTGTCGGCAGCAAATGTCTAAAGGTTTATTTCGTAAATAACCATTCAAAAAGCCGGCATTAAAAGAATCTCCTGCTGATGTGGTGTCAACAACATTTGAAATAGGTTTCGGCACAACTTGTCCATATTGAGAAGTTTGAGAATCTGAAAAAATCGCACCATTTCGACCGCACTTTACAACTACTTTTGGTATGCCAATTTGATGTAAGCGCGTTAGCGTGGCCGGTTCATTTGTGTCGTTCCACAATAATTGCTCATCATCAAAGGTAACAAGCGCGAGACTCACACAAGGTAATAATTGCAAATAACAATCTTGAGCCTCTTGGAATGAATCCCAGAGTTTAGGTCTAAAATTACTATCAAAAGAGATTTGCACGCCTTTTTTAGCTAATTTTATAAGCTGTTCAAGCAAAAAAGTGCGGTCATTTTTAGGTAAGATCGCAAGTGAAATGCCACTCAAGTAAATCATATCCACTTGT > 1/1647084‑1647574 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |