| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,627,418 | T→G | Y137S (TAC→TCC) | unknown ← | Pyridoxal phosphate‑containing protein YggS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,627,418 | 0 | T | G | 100.0% | 236.3 / NA | 82 | Y137S (TAC→TCC) | unknown | Pyridoxal phosphate‑containing protein YggS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (40/42); total (40/42) | |||||||||||
TGGTGGAACCACATTTGATTGCCATCTGCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGTATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGCTGTTGGCAGAATTGAATTTTTTCCACTCCCTCCTGTACATAAT > 1/1627173‑1627658 | tggtggAACCACATTTGATTGCCATCTGCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTa > 1:603985/1‑251 (MQ=255) ggtggAACCACATTTGATTGCCATCTGCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTa > 1:618978/1‑250 (MQ=255) gtggAACCACATTTGATTGCCATCTGCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTAc < 1:8307/250‑1 (MQ=255) tttGATTGCCATCTGAATACCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTCCAAACAACACACGCATTTAATAAAACACTTGCTCCGGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGc < 1:486212/251‑1 (MQ=255) tGATTGCCATCTGCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTg > 1:23291/1‑248 (MQ=255) tGATTGCCATCTGCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTg > 1:889859/1‑248 (MQ=255) aTTGCCATCTGCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGat < 1:200951/251‑1 (MQ=255) gCCATCTGCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATAtt > 1:252404/1‑251 (MQ=255) cTGCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCAc > 1:363019/1‑249 (MQ=255) gCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCAcc > 1:882481/1‑248 (MQ=255) tcatcGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTaa > 1:401988/1‑251 (MQ=255) tcGGTCATGCCCATGAATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGAc < 1:249081/251‑1 (MQ=255) ggTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACAt > 1:345553/1‑251 (MQ=255) gTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACCCGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGc < 1:748726/218‑1 (MQ=255) gTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACAtt > 1:23408/1‑251 (MQ=255) cATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGAc < 1:403007/240‑1 (MQ=255) ttGGATAAGGTGTCGATTTGGGGGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTAAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGgcgc < 1:762117/250‑1 (MQ=255) aTGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACCCTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGa < 1:150828/238‑1 (MQ=255) tGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGc < 1:569298/216‑1 (MQ=255) tGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACa > 1:194921/1‑239 (MQ=255) tGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAgcggcg > 1:130335/1‑249 (MQ=255) aggATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAgcggcg > 1:730647/2‑249 (MQ=255) ggATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAgc < 1:689981/244‑1 (MQ=255) gtgtCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAAt < 1:301560/224‑1 (MQ=255) gtgtCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGc < 1:502295/249‑1 (MQ=255) cGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTa > 1:661290/1‑251 (MQ=255) cAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAAc < 1:678469/251‑1 (MQ=255) tgttgtAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAgc > 1:187195/1‑210 (MQ=255) gttgtAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCg > 1:460686/1‑251 (MQ=255) gttgtAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCg > 1:196162/1‑251 (MQ=255) gtAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAAt < 1:136294/193‑1 (MQ=255) cccacGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAggg < 1:524302/249‑1 (MQ=255) cacacGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAggg < 1:460510/251‑1 (MQ=255) cacacGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAggg < 1:716247/251‑1 (MQ=255) cATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACgt < 1:242686/205‑1 (MQ=255) cATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAggg > 1:242942/1‑245 (MQ=255) tGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCa > 1:682923/1‑251 (MQ=255) aTAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGt > 1:221649/1‑251 (MQ=255) cacTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCAtt > 1:900419/1‑141 (MQ=255) tGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAA‑TTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCAt > 1:491602/1‑235 (MQ=255) tGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGcca > 1:693696/1‑250 (MQ=255) ccACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACgg > 1:116769/1‑251 (MQ=255) catcatCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGtt > 1:868875/1‑251 (MQ=255) atcGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGgcg < 1:603384/199‑1 (MQ=255) atcGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTAt < 1:572239/251‑1 (MQ=255) tcGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATg > 1:92448/1‑158 (MQ=255) cGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAat < 1:840592/225‑1 (MQ=255) gTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGAc > 1:127687/1‑133 (MQ=255) gTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGc > 1:773156/1‑152 (MQ=255) gTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCAt < 1:225439/208‑1 (MQ=255) gTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTg > 1:782433/1‑250 (MQ=255) gTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTg > 1:272175/1‑250 (MQ=255) gTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGCTTTATTGGATTg > 1:731460/1‑250 (MQ=255) ggAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACgg > 1:1068/1‑251 (MQ=255) cATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCTCCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATaa < 1:856570/251‑1 (MQ=255) cATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATaa < 1:748299/251‑1 (MQ=255) cATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATaa < 1:157069/251‑1 (MQ=255) gCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTg < 1:148130/226‑1 (MQ=255) aCGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTAtt < 1:465008/222‑1 (MQ=255) cGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAGACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCAtt > 1:169295/1‑250 (MQ=255) ggCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGc < 1:342135/179‑1 (MQ=255) ggCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGc < 1:580583/242‑1 (MQ=255) ggCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAg > 1:633806/1‑251 (MQ=255) ggCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAg > 1:219960/1‑251 (MQ=255) ggCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAg > 1:548495/1‑251 (MQ=255) tGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAatat < 1:423699/250‑1 (MQ=255) gTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATtgtg > 1:480906/1‑250 (MQ=255) tAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCAGAGAACGTTGTGCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGAAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGc < 1:738929/250‑1 (MQ=255) ttCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAatat < 1:759180/239‑1 (MQ=255) ttCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTGTCTGGCTTCATTGCTGATATTCGCCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCGCCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGCTGTTGGc < 1:210659/251‑1 (MQ=255) gtgtTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAAt < 1:604036/215‑1 (MQ=255) gtgtTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAatat < 1:36222/233‑1 (MQ=255) gtgtTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGCTGTTGGCAga < 1:224271/248‑1 (MQ=255) gtTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGcc < 1:11315/205‑1 (MQ=255) gtTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGCTGTTGGCAgaattga > 1:255140/1‑251 (MQ=255) gTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGCTGTTGGCAGAATTGAATTTTTTCCa > 1:482886/1‑251 (MQ=255) aaaTTTCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTc < 1:482625/154‑1 (MQ=255) tttCACCGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGCTGTTGGCAGAATTGAATTTTTTCCActccctcc < 1:298275/251‑1 (MQ=255) ccGGGCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGCTGTTGGCAGAATTGAATTTTTTCCACTCCCTCCTGTAc < 1:668811/251‑1 (MQ=255) gggCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGAc < 1:864674/54‑1 (MQ=255) gggCTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGCTGTTGGCAGAATTGAATTTTTTCCACTCCCTCCTGTACAt > 1:193422/1‑251 (MQ=255) cTGGACGCCGGATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGCTGTTGGCAGAATTGAATTTTTTCCACTCCCTCCTGTACATAAt < 1:321885/251‑1 (MQ=255) | TGGTGGAACCACATTTGATTGCCATCTGCATATCATCGGTCATGCCCATGGATAAGGTGTCGATTTGGGCGTTCGGCAAGGCTTGTTGTAATTGTTCAAACAACACACGCATTTGATAAAACACTTGCTCCTGCCGAGCCACATCATCGGTAGGTTCGGGAATCGCCATTAAGCCACGCAGGCATAAGTGCGGTAAGTTTTCCAGGTGTTTTGCAAGGTCTAAAATTTCACCGGGCTGGACGCCGTATTTACTGGCTTCATTGCTGATATTCACCTGAATTAAGACATTGAGCGGCGCTTTATGCGGAGAACGTTGTTCATTTAAACGATCGGCGATTTTGGCGCGATCAAGGGTTTGCATCCAGTCAAAATATTCCGCCACCAAACGGGTTTTATTGGATTGCAACGGGCCGATAAAATGCCATTCCAAGTTAATATTGTGCTGTTGGCAGAATTGAATTTTTTCCACTCCCTCCTGTACATAAT > 1/1627173‑1627658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |