| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,621,683 | T→C | M148V (ATG→GTG) | unknown ← | Thiol peroxidase, Bcp‑type (EC 1.11.1.15) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,621,683 | 0 | T | C | 100.0% | 154.6 / NA | 52 | M148V (ATG→GTG) | unknown | Thiol peroxidase, Bcp‑type (EC 1.11.1.15) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (23/29); total (23/29) | |||||||||||
TTTGGTGTCGCTATTGGTCCTTATTGGCATAATAACGCAAGTTTAAGCATTGGTTTGCGAGATTGGAAAATATCTGCCTACGCAGCTGTGAACCAGGGTAAACATGGGGAACGCCAAAACCAACTTGGTGTAAAACTGAATTACTACTGGTAGTAAAAACACCGAAAAAAACGACCGCACTTTTGTGCGGTCTTTCGTTTTAGTTCGATGAATAACTCACTTCTGCAAATAATCCAGCATCACTTGATGGTGATCCATCGCTTTAAATTTATCAAATACCTGTTCGACTTTTCCCTGTTCATCAATTAAAAAGCTGATCCGGTGAATGCCGTCATATGTGCGTCCCATAAATTTTTTCTCGCCCCACACACCGAATTGTTCCGCGACCTGATGGTTTTCGTCGGATAATAAAATGAAGTTCAATACTTTCTTTTCTGCAAATTGGGCTAATTTTTTCGGGCTGTCCGGGCTAATGC > 1/1621444‑1621919 | tttGGTGTCGCTATTGGTCCTTATTGGCATAATAACGCAAGTTTAAGCATTGGTTTGCGAGATTGGAAAATATCTGCCTACGCAGCTGTGAACCAGGGTAAACATGGGGAACGCCAAAACCAACTTGGTGTAAAACTGAATTACTACTGGTAGTAAAAACACCGAAAAAAACGACCGCACTTTTGTGCGGTCTTTCGTTTTAGTTCGATGAATAACTCACTTCTGCAAATAATCCAGCACCACTTGATgg < 1:780787/250‑1 (MQ=255)tttGGTGTCGCTATTGGTCCTTATTGGCATAATAACGCAAGTTTAAGCATTGGTTTGCGAGATTGGAAAATATCTGCCTACGCAGCTGTGAACCAGGGTAAACATGGGGAACGCCAAAACCAACTTGGTGTAAAACTGAATTACTACTGGTAGTAAAAACACCGAAAAAAACGACCGCACTTTTGTGCGGTCTTTCGTTTTAGTTCGATGAATAACTCACTTCTGCAAATAATCCAGCACCACTTGATGGt < 1:571363/251‑1 (MQ=255)tttGGTGTCGCTATTGGTCCTTATTGGCATAATAACGCAAGTTTAAGCATTGGTTTGCGAGATTGGAAAATATCTGCCTACGCAGCTGTGAACCAGGGTAAACATGGGGAACGCCAAAACCAACTTGGTGTAAAACTGAATTACTACTGGTAGTAAAAACACCGAAAAAAACGACCGCACTTTTGTGCGGTCTTTCGTTTTAGTTCGATGAATAACTCACTTCTGCAAATAATCCAGCACCACTTGATGGt < 1:748480/251‑1 (MQ=255) tgtCGCTATTGGTCCTTATTGGCATAATAACGCAAGTTTAAGCATTGGTTTGCGAGATTGGAAAATATCTGCCTACGCAGCTGTGAACCAGGGTAAACATGGGGAACGCCAAAACCAACTTGGTGTAAAACTGAATTACTACTGGTAGTAAAAACACCGAAAAAAACGACCGCACTTTTGTGCGGTCTTTCGTTTTAGTTCGATGAATAACTCACTTCTGCAAATAATCCAGCACCACTTGATGGTGATcc < 1:24430/251‑1 (MQ=255) 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1:585591/1‑251 (MQ=255) tGGTGTAAAACTGAATTACTACTGGTAGTAAAAACACCGAAAAAAACGACCGCACTTTTGTGCGGTCTTTCGTTTTAGTTCGATGAATAACTCACTTCTGCAAATAATCCAGCACCACTTGATGGTGATCCATCGCTTTAAATTTATCAAATACCTGTTCGACTTTTCCCTGTTCATCAATTAAAAAGCTGATCCGGTGAATGCCGTCATATGTGCGTCCCATAAATTTTTTCTCGCCCCACACACCGAAt < 1:831121/251‑1 (MQ=255) gtgtAAAACTGAATTACTACTGGTAGTAAAAACACCGAAAAAAACGACCGCACTTTTGTGCGGTCTTTCGTTTTAGTTCGATGAATAACTCACTTCTGCAAATAATCCAGCACCACTTGATGGTGATCCATCGCTTTAAATTTATCAAATACCTGTTCGACTTTTCCCTGTTCATCAATTAAAAAGCTGATCCGGTGAATGCCGTCATATGTGCGTCCCATAAATTTTTTCTCGCCCCACACACCGAATTg > 1:871307/1‑251 (MQ=255) aCTGAATTACTACTGGTAGTAAAAACACCGAAAAAAACGACCGCACTTTTGTGCGGTCTTTCGTTTTAGTTCGATGAATAACTCACTTCTGCAAATAATCCAGCACCACTTGATGGTGATCCATCGCTTTAAATTTATCAAATACCTGTTCGACTTTTCCCTGTTCATCAATTAAAAAGCTGATCCGGTGAATGCCGTCATAtg > 1:816180/1‑204 (MQ=255) 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1:93644/251‑1 (MQ=255) aaaTAATCCAGCACCACTTGATGGTGATCCATCGCTTTAAATTTATCAAATACCTGTTCGACTTTTCCCTGTTCATCAATTAAAAAGCTGATCCGGTGAATGCCGTCATATGTGCGTCCCATAAATTTTTTCTCGCCCCACACACCGAATTGTTCCGCGACCTGATGGTTTTCGTCGGATAATAAAATGAAGTTCAATACTTTCTTTTCTGCAAATTGGGCTAATTTTTTCGGGCTGTCCGGGCTAATGc > 1:545273/1‑250 (MQ=255) atCCAGCACCACTTGATGGTGATCCATCGCTTTAAATTTATCAAATACCTGTTCGACTTTTCCCTGTTCATCAATTAAAAAGCTGATCCGGTGAATGCCGTCATATGTGCGTCCCATAAATTTTTTCTCGCCCCACACACCGAATTGTTCCGCGACCTGATGGTTTTCGTCGGATAATAAAATGAAGTTCAATACTTTCTTTTCTGCaa < 1:705655/209‑1 (MQ=255) atCCAGCACCACTTGATGGTGATCCATCGCTTTAAATTTATCAAATACCTGTTCGACTTTTCCCTGTTCATCAATTAAAAAGCTGATCCGGTGAATGCCGTCATATGTGCGTCCCATAAATTTTTTCTCGCCCCACACACCGAATTGTTCCGCGACCTGATGGTTTTCGTCGGATAATAAAATGAAGTTCAATACTTTCTTTTCTGCAAATTGGGCTAATTTTTTCGGGCTGTCCGGGCt < 1:695673/240‑1 (MQ=255) | TTTGGTGTCGCTATTGGTCCTTATTGGCATAATAACGCAAGTTTAAGCATTGGTTTGCGAGATTGGAAAATATCTGCCTACGCAGCTGTGAACCAGGGTAAACATGGGGAACGCCAAAACCAACTTGGTGTAAAACTGAATTACTACTGGTAGTAAAAACACCGAAAAAAACGACCGCACTTTTGTGCGGTCTTTCGTTTTAGTTCGATGAATAACTCACTTCTGCAAATAATCCAGCATCACTTGATGGTGATCCATCGCTTTAAATTTATCAAATACCTGTTCGACTTTTCCCTGTTCATCAATTAAAAAGCTGATCCGGTGAATGCCGTCATATGTGCGTCCCATAAATTTTTTCTCGCCCCACACACCGAATTGTTCCGCGACCTGATGGTTTTCGTCGGATAATAAAATGAAGTTCAATACTTTCTTTTCTGCAAATTGGGCTAATTTTTTCGGGCTGTCCGGGCTAATGC > 1/1621444‑1621919 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |