| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,602,084 | C→G | S226S (TCC→TCG) | unknown → | Phospholipid ABC transporter ATP‑binding protein MlaF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,602,084 | 0 | C | G | 100.0% | 223.6 / NA | 74 | S226S (TCC→TCG) | unknown | Phospholipid ABC transporter ATP‑binding protein MlaF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (37/37); total (37/37) | |||||||||||
ATGGCGCGTCGTGCCGCGCTCGCCCGTGCCATTGCGTTAGATCCGGATTTAATCATGTTCGACGAACCCTTTACGGGACAAGATCCCATCAGCATGGGCGTGATTATCAGCTTAATCAAACGGCTAAATGAAGCGTTGAATTTAACGTCTATTGTGGTCTCCCATGATGTGCAGGAAGTATTGAGCATCGCCGATTATGCCTATATTATCGCCGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCCGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACTTTGCCCGCGCAATGGGTCGTGCAGGCTTTTTGCTATTCGGCGCGCTTATCGGCAAACCGCAAATTAACAAGCATTTCCCGTTAT > 1/1601842‑1602327 | aTGGCGCGTCGTGCCGCGCTCGCCCGTGCCATTGCGTTAGATCCGGATTTAATCATGTTCGACGAACCCTTTACGGGACAAGATCCCATCAGCATGGGCGTGATTATCAGCTTAATCAAACGGCTAAATGAAGCGTTGAATTTAACGTCTATTGTGGTCTCCCATGATGTGCAGGAAGTATTGAGCATCGCCGATTATGCCTATATTATCGCCGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCt < 1:410698/251‑1 (MQ=255) 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ccGATTATGCCTATATTATCGCCGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACTTTGCCCGCGCAATGGGTCGTGCAGGCTTTTTGCTATTc < 1:323990/250‑1 (MQ=255) cGATTATGCCTATATTATCGCCGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACTTTGCCCGCGCAATGGGTCGTGCAGGCTTTTTGCTATTCgg < 1:817745/251‑1 (MQ=255) aTTATGCCTATATTATCGCCGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCaattt < 1:32179/177‑1 (MQ=255) gCCTATATTATCGCCGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACTTTGCCcgcg < 1:110438/213‑1 (MQ=255) atatTATCGCCGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGcc > 1:530985/1‑130 (MQ=255) atatTATCGCCGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACtt < 1:108398/201‑1 (MQ=255) tattatCGCCGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACATTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACTTTGCCCGCGCAATGGGTCGTGCAGGCTTTTTGCTATTCGGCGCGCTTATCgg > 1:248638/1‑251 (MQ=255) ccGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACTTTGCCCGCGCAATGGGTCGTGc > 1:425547/1‑213 (MQ=255) cAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACt > 1:674716/1‑186 (MQ=255) gCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACt > 1:481419/1‑104 (MQ=255) gtgATTGCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTTCGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGa < 1:270300/164‑1 (MQ=255) gCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACTTTGCCCGCGCAATGGGTCGTGCAGGCTTTTTGCTCTTc > 1:706851/1‑212 (MQ=255) gCCGAAGGCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACTTTGCCCGCGCAATGGGTCGTGCAGGCTTTTTGCTATTCGGCGCGCTTATCGGCAAACCGCAAATTAACAAGCAttt > 1:43544/1‑250 (MQ=255) gCTCATCGGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACTTTGCCCGCGCAATGGGTCGTGCAGGCTTTTTGCTATTCGGCGCGCTTATCGGCAAACCGCAAATTAACAAGCATTTCCCGttat > 1:403739/1‑251 (MQ=255) | ATGGCGCGTCGTGCCGCGCTCGCCCGTGCCATTGCGTTAGATCCGGATTTAATCATGTTCGACGAACCCTTTACGGGACAAGATCCCATCAGCATGGGCGTGATTATCAGCTTAATCAAACGGCTAAATGAAGCGTTGAATTTAACGTCTATTGTGGTCTCCCATGATGTGCAGGAAGTATTGAGCATCGCCGATTATGCCTATATTATCGCCGATCAGCATGTGATTGCCGAAGGCTCATCCGAGCAGCTATTGGCGAGCCAAGATCCCCAAGTGAAACAGTTTTTACAAGGTCAGGCGGACGGTCCGGTACGTTTTCACTACCCTGCGCCAAATTACATTGAGGAGTTGTTTGAATGCTAACCAATTTAATTTCAGCCCTCGGACGTAACGCTATTAACTTTGCCCGCGCAATGGGTCGTGCAGGCTTTTTGCTATTCGGCGCGCTTATCGGCAAACCGCAAATTAACAAGCATTTCCCGTTAT > 1/1601842‑1602327 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |