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atatAATCCGGTGCCAATTCGTCAATTTTTTCGGCTAACAAATAATCATGTTCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAACCGCTCCGCCAAACTGCGTAATGTTTCATGATTACCAATCACCCCTGCAATTTCTACATTCAAACCACCATAATAGTTTTTCATTAAAATATCACCGAGGCAATGGGCTTCTTTAGTAACTAAAATGAc > 1:855490/1‑230 (MQ=255) atatAATCCGGTGCCAATTCGTCAATTTTTTCGGCTAACAAATAATCATGTTCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAACCGCTCCGCCAAACTGCGTAATGTTTCATGATTACCAATCACCCCTGCAATTTCTACATTCAAACCACCATAATAGTTTTTCATTAAAATATCACCGAGGCAATGGGCTTCTTTAGTAACTAAAATGACAATTCGCTTATAttt > 1:104440/1‑245 (MQ=255) atatAATCCGGTGCCAATTCGTCAATTTTTTCGGCTAACAAATAATCATGTTCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAACCGCTCCGCCAAACTGCGTAATGTTTCATGATTACCAATCACCCCTGCAATTTCTACATTCAAACCACCATAATAGTTTTTCATTAAAATATCACCGAGGCAATGGGCTTCTTTAGTAACTAAAATGACAATTCGCTTATATTTtgtg > 1:227613/1‑249 (MQ=255) 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ggTGCCAATTCGTCAATTTTTTCGGCTAACAAATAATCATGTTCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAACCGCTCCGCCAAACTGCGTAATGTTTCATGATTACCAATCACCCCTGCAATTTCTACATTCAAACCACCATAATAGTTTTTCATTAAAATATCACCGAGGCAATGGGCTTCTTTAGTAACTAAAATGACAATTCGCTTATATTTTGTGCTAATTAAACg > 1:901947/1‑251 (MQ=255) gTGCCAATTCGTCAATTTTTTCGGCTAACAAATAATCATGTTCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAACCGCTCCGCCAAACTGCGTAATGTTTCATGATTACCAATCACCCCTGCAATTTCTACATTCAAACCACCATAATAGTTTTTCATTAAAATATCACCGAGGCAATGGGCTTCTTTAGTAACTAAAATGACAATTCGATTATATTgtgttggcaaaatatat > 1:57927/1‑238 (MQ=255) tGCCAATTCGTCAATTTTTTCGGCTAACAAATAATCATGTTCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAACCGCTCCGCCAAACTGCGTAATGTTTCATGATTACCAATCACCCCTGCAATTTCTACATTCAAACCACCATAATAGTTTTTCATTAAAATATCACCGAGGCAATGGGCTTCTTTAGTAACTAAAATGACAATTCGCTTATATTTTGTGCTAATTAAACGAc < 1:76149/251‑1 (MQ=255) 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aaCAAATAATCATGTTCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAACCGCTCCGCCAAACTGCGTAATGTTTCATGATTACCAATCACCCCTGCAATTTCTACATTCAAACCACCATAATAGTTTTTCATTAAAATATCACCGAGGCAATGGGCTTCTTTAg > 1:697065/1‑181 (MQ=255) aaaTAATCATGTTCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAACCGCTCCGCCAAACTGCGTAATGTTTCATGATTACCAATCACCCCTGCAATTTCTACATTCAAACCACCATAATAGTTTTTCATTAAAATATCACCGAGGCAATGGGCTTCTTTAGTAACTAAAATGACAATTCGCTTATATTTTGTGCTAATTAAACGACAATTCGTTCCCGGCGGTAAACTCAGTTc < 1:217187/251‑1 (MQ=255) atCATGTTCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAACCGCTCCGCCAAACTGCGTAATGTTTCATGATTACCAATCACCCCTGCAATTTCTACATTCAAACCACCATAATAGTTTTTCATTAAAATATCACCGAGGCAATgg < 1:589852/163‑1 (MQ=255) tCATGTTCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAAc < 1:598969/57‑1 (MQ=255) | CTATAGGTGTGATCAATATTAATAAAATGCGCTGTCGCACCGATAATTTTTACACCGCGCTCATAAGCCTGCTGATAAGGTTTTGCGCCGATAAATGCAGGCAAAAACGAATGGTGAATGTTAATCACCCGATTAGGATAACGCGCTACAAATTTCGGATTTAAGACCCGCATATATTTTGCCAACACAATATAATCCGGTGCCAATTCGTCAATTTTTTCGGCTAACAAATAATCATGTCCTTCACGGGTTAAATTTTGATGGCTGATCCAGAAAAATGGAATATCAAACCGCTCCGCCAAACTGCGTAATGTTTCATGATTACCAATCACCCCTGCAATTTCTACATTCAAACCACCATAATAGTTTTTCATTAAAATATCACCGAGGCAATGGGCTTCTTTAGTAACTAAAATGACAATTCGCTTATATTTTGTGCTAATTAAACGACAATTCGTTCCCGGCGGTAAACTCAGTTC > 1/1577236‑1577714 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |