| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 94,025 | G→A | Y278Y (TAC→TAT) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 94,025 | 0 | G | A | 100.0% | 208.8 / NA | 74 | Y278Y (TAC→TAT) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (51/23); total (51/23) | |||||||||||
ATTTATCACTGCGGTAGGTGACCAGTCCGGTTTTAAATAATGCCGTACCGGCGTTAAGCTTAGTTAAAAAATAACCCTGATGCGCTGCCATCACTTACTCCACAAGCCGATAGGCGACACCATGGCGTCCGCTCGAATCCGGCAACTCTTTAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAGCCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTGAGCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCGTACATGTTTACATGATAACGGTCGGGTACAATGCCCAAG‑CGGGCGTAAGTATCATTGCGCAAATGCGCGGTGATGACGTTAGGATTGGGCATCACCACCTGCCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCGACAGAGCGGTCTAACATTGCCCCGGTATTAGCGCCGAAAAAATGCACTCCGGCAGTGGTATTATCAGATCTGTTGGCACCGCAAAAATACCA > 1/93781‑94270 | aTTTATCACTGCGGTAGGTGACCAGTCCGGTTTTAAATAATGCCGTACCGGCGTTAAGCTTAGTTAAAAAATAACCCTGATGCGCTGCCATCACTTACTCCACAAGCCGATAGGCGACACCGTGGCGTCCACTGGAATCCGGCAACTCTTGAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAACCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTCACCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCATAc > 1:887061/1‑248 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aTGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCTACAGAGCGGTCTAACATTGCACCGGTATTGGTGCCGAAAAAATGCACGCCGGCAGTGGtattgtcgg > 1:310669/1‑245 (MQ=255) ggTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATcactac > 1:282663/1‑123 (MQ=255) gactgtgCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCTACAGAGCGGTCTAACATTGCACCGGTATTGGTGCCGAAAAAATGCACGCCGGCAGTGGtattgtcggctcggttgg > 1:85493/4‑237 (MQ=255) aTTGTGCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCTACAGAGc > 1:521410/1‑181 (MQ=255) ggATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCTACAGAGc < 1:542566/171‑1 (MQ=255) ggATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCTACAGAGCGGTCTAACAt < 1:175057/181‑1 (MQ=255) ggATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCTACAGAGCGGTCTAACATTGCACCGGTATTGGTGCCGAAAAAATGCACGCCGGCAGTGGTATTGTCGGCTCGGTTGGCACCGCaaaaa > 1:7784/1‑251 (MQ=255) ggATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCTACAGAGCGGTCTAACATTGCACCGGTATTGGTGCCGAAAAAATGCACGCCGGCAGTGGTATTGTCGGCTCGGTTGGCACCGCaaaaa > 1:719808/1‑251 (MQ=255) ggATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCTACAGAGCGGTCTAACATTGCACCGGTATTGGTGCCGAAAAAATGCACGCCGGCAGTGGTATTGTCGGCTCGGTTGGCACCGCaaaaa > 1:652987/1‑251 (MQ=255) atgCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCTACAGAGCGGTCTAACATTGCACCGGTATTGGTGCCGAAAAAATGCACGCCGGCAGTGGTATTGTCGGCTCGGTTGGCACCGCAAAAATACCa > 1:212184/1‑251 (MQ=255) | ATTTATCACTGCGGTAGGTGACCAGTCCGGTTTTAAATAATGCCGTACCGGCGTTAAGCTTAGTTAAAAAATAACCCTGATGCGCTGCCATCACTTACTCCACAAGCCGATAGGCGACACCATGGCGTCCGCTCGAATCCGGCAACTCTTTAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAGCCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTGAGCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCGTACATGTTTACATGATAACGGTCGGGTACAATGCCCAAG‑CGGGCGTAAGTATCATTGCGCAAATGCGCGGTGATGACGTTAGGATTGGGCATCACCACCTGCCCCAAGGTTGAGTTTGAGATAGCGGTTAGCACATCATCGGCAGTATGCCCGACAGAGCGGTCTAACATTGCCCCGGTATTAGCGCCGAAAAAATGCACTCCGGCAGTGGTATTATCAGATCTGTTGGCACCGCAAAAATACCA > 1/93781‑94270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |