| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,534,237 | T→C | L174L (TTA→TTG) | unknown ← | Transcriptional regulator/sugar kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,534,237 | 0 | T | C | 100.0% | 202.3 / NA | 67 | L174L (TTA→TTG) | unknown | Transcriptional regulator/sugar kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (35/32); total (35/32) | |||||||||||
TCGTGATTAATGAGCGCTTGAAGCTCGTTTAAGCGCGGCACAATCAAATGATTAATATTGATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAATAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTCTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAAC > 1/1533992‑1534483 | tCGTGATTAATGAGCGCTTGAAGCTCGTTTAAGCGCGGCACAATCAAATGATTAATATTGATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGa < 1:322049/251‑1 (MQ=255) tGATTAATGAGCGCTTGAAGCTCGTTTAAGCGCGGCACAATCAAATGATTAATATTGATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGAttt > 1:823251/1‑251 (MQ=255) cTTGAAGCTCGTTTAAGCGCGGCACAATCAAATGATTAATATTGATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGa > 1:415960/1‑235 (MQ=255) acaATCAAATGATTAATATTGATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGttt < 1:152393/251‑1 (MQ=255) caATCAAATGATTAATATTGATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTtta > 1:557208/1‑251 (MQ=255) tCAAATGATTAATATTGATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTttaatt < 1:225252/251‑1 (MQ=255) gATTAATATTGATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTtta < 1:105148/242‑1 (MQ=255) aTTAATATTGATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATaa < 1:504104/250‑1 (MQ=255) gATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTAc > 1:210259/1‑221 (MQ=255) ttttGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATcc < 1:636225/251‑1 (MQ=255) ttttGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATcc < 1:585767/251‑1 (MQ=255) ttttGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATcc < 1:889134/251‑1 (MQ=255) gTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAAtt > 1:232196/1‑251 (MQ=255) gTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAAtt > 1:273480/1‑251 (MQ=255) ccTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAGCTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTAc < 1:195006/213‑1 (MQ=255) ccTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTttaatta > 1:119032/1‑228 (MQ=255) gTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTc > 1:73036/1‑247 (MQ=255) cTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTTGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGt > 1:205389/1‑251 (MQ=255) gCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGt < 1:424825/241‑1 (MQ=255) ccTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAgg > 1:238685/1‑247 (MQ=255) tCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAAt > 1:563897/1‑169 (MQ=255) tCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACgg < 1:467064/238‑1 (MQ=255) tCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATcgg > 1:65776/1‑251 (MQ=255) tCTGATAACACGCTAAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATcgg > 1:658656/1‑251 (MQ=255) cTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATcggg < 1:702363/251‑1 (MQ=255) gCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAagtg > 1:784515/1‑251 (MQ=255) tGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAagtgag < 1:695374/251‑1 (MQ=255) aTTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAg < 1:754321/132‑1 (MQ=255) gTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGaa > 1:241468/1‑251 (MQ=255) cTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACgg < 1:480811/197‑1 (MQ=255) cTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACgg > 1:828426/1‑203 (MQ=255) aCAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTc < 1:829189/178‑1 (MQ=255) gTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCttttt > 1:877022/1‑251 (MQ=255) catcatCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTAcc < 1:869620/251‑1 (MQ=255) catcatCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTAc > 1:408835/1‑250 (MQ=255) tcatcaCAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTTATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAg > 1:867538/1‑251 (MQ=255) catcaCAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGt < 1:199064/181‑1 (MQ=255) catcaCAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGtt > 1:486061/1‑234 (MQ=255) gTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTAt > 1:384017/1‑251 (MQ=255) aTCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAg < 1:827508/251‑1 (MQ=255) tCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAgg > 1:767197/1‑180 (MQ=255) aCCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAAt > 1:846619/1‑98 (MQ=255) ccAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTaaa < 1:553938/251‑1 (MQ=255) aaTAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGc < 1:398640/246‑1 (MQ=255) tAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGa > 1:805086/1‑251 (MQ=255) gTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACg > 1:819731/1‑249 (MQ=255) tGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGt < 1:376526/251‑1 (MQ=255) ttCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCaataa < 1:50944/251‑1 (MQ=255) ttCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCaataa < 1:708011/251‑1 (MQ=255) aaTTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGc < 1:519899/251‑1 (MQ=255) aaTTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGc < 1:134116/251‑1 (MQ=255) aTTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGc > 1:415878/1‑250 (MQ=255) gAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTc < 1:194231/250‑1 (MQ=255) atTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATcc < 1:3280/85‑1 (MQ=255) atTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCaataa > 1:664393/1‑230 (MQ=255) atTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCa > 1:177685/1‑251 (MQ=255) ttGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGCGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCaa > 1:98534/1‑251 (MQ=255) gAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCaataa > 1:503434/1‑227 (MQ=255) cGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAAttt < 1:526255/251‑1 (MQ=255) ggTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGaa > 1:41039/1‑99 (MQ=255) gtgtAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGttt < 1:855540/52‑1 (MQ=255) gtgtAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCaataa < 1:764369/219‑1 (MQ=255) gtgtAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCa > 1:671604/1‑251 (MQ=255) gtgtAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCa > 1:344566/1‑251 (MQ=255) gtgtAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCa > 1:11635/1‑251 (MQ=255) gtAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTc > 1:39428/1‑233 (MQ=255) tAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAAc < 1:836275/251‑1 (MQ=255) | TCGTGATTAATGAGCGCTTGAAGCTCGTTTAAGCGCGGCACAATCAAATGATTAATATTGATTTTGTCCTGTTCCCTGCTAAATAACAGCTCCCCTTCTGATAACACGCTGAGGTTAATTTCATCGTCCAACTGTAAAAACAGTACATCATCACAGTTGATCACATTACCCAAGGTGGATTCCGCCAATAACCAGGTTTTGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAATAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTCTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAAC > 1/1533992‑1534483 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |