| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,513,975 | C→T | G96D (GGT→GAT) | unknown ← | Outer membrane receptor for lactoferrin or transferrin, TonB‑dependent protein A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,513,975 | 0 | C | T | 100.0% | 233.8 / NA | 84 | G96D (GGT→GAT) | unknown | Outer membrane receptor for lactoferrin or transferrin, TonB‑dependent protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (34/50); total (34/50) | |||||||||||
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |