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aTAGGCGACACCGTGGCGTCCACTGGAATCCGGCAACTCTTGAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAACCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTCACCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGt > 1:535475/1‑251 (MQ=255) aGGCGACACCGTGGCGTCCACTGGAATCCGGCAACTCTTGAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAACCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTCACCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATGccaagt > 1:266142/1‑169 (MQ=255) aGGCGACACCGTGGCGTCCACTGGAATCCGGCAACTCTTGAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAACCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTCACCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATg > 1:761762/1‑199 (MQ=255) aGGCGACACCGTGGCGTCCACTGGAATCCGGCAACTCTTGAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAACCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTCACCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGAt < 1:819817/219‑1 (MQ=255) aGGCGACACCGTGGCGTCCACTGGAATCCGGCAACTCTTGAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAACCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTCACCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGttt > 1:475453/1‑251 (MQ=255) aGGCGACACCGTGGCGTCCACTGGAATCCGGCAACTCTTGAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAACCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTCACCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGttt > 1:708082/1‑251 (MQ=255) acacCGTGGCGTCCACTGGAATCCGGCAACTCTTGAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAACCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTCACCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCATACATGTTTACATGATAACGGTCCGGCACAATG‑CCAAGTCGGGCGTACGTATCATTGCGTAAATGTGCGGTAATCACGTTAGGATTAGGCATCACTACTTGTCCCAAGGTTGAGTTTGAGAt > 1:60546/1‑251 (MQ=255) ccgtGGCGTCCACTGGAATCCGGCAACTCTTGAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAACCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTCACCATTAATGGTTAAGAt > 1:646513/4‑107 (MQ=255) | TAAATCAAGGTAAAAATTGGGCGTGATATAACCGCCCGATTGGTGCGTAACATCCGCTTCTTGATTGCCGATAAAATGCGCGTTATAGACTTTAAACGGGGCTTTAATCCGCCATTTATCACTGCGGTAGGTGACCAGTCCGGTTTT‑AAATAATGCCGTACCGGCGTTAAGCTTAGTT‑AAAAAATAACCCTGATGCGCTGCCATCACTTACTCCACAAGCCGATAGGCGACACCATGGCGTCCGCTCGAATCCGGCAACTCTTTAACCCGCCAATCCAAATCGTTGTGATAGCCGCTCGCCGGGATAATTAACCATTTTTGAGCATTAATGGTTAAGATTGTGCGCGGGATGATGCCGTACATGTTTACATGATAACGGTCGGGTACAATGCCCAAG‑CGGGCGTAAGTATCATTGCGCAAATGCGCGGTGATGACGTTAGGATTGGGCATCACCACCTGCCCCAAGGTTGAGTTTGAGAT > 1/93668‑94147 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |