| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,494,806 | T→C | E14E (GAA→GAG) | unknown ← | Integration host factor alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,494,806 | 0 | T | C | 100.0% | 200.7 / NA | 66 | E14E (GAA→GAG) | unknown | Integration host factor alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (33/33); total (33/33) | |||||||||||
ACCTTTTCAACCCGGTTGCGCAATTTTTGTCCCGGTTTGAACACCACCACACGACGGGCAGAAACCGGTACGCTTTCACCGGTTTTCGGGTTTCTACCCGGACGGGAAGCTTTATCACGTAATTCAAAATTACCAAAACCAGATAATTTCACGTCATTTCCTGTTTCCAAAGCCACACGGATTTCTTCAAAAAAGCTTTCGACCAAATCCTTTGCCTCACGTTTACTGAGATGGAATTTTTCAATAAGATTTTCGGCGAGTTCTACTTTAGTTAATGTCATAGTTTAATCTCTCAAATAAGCATTAAAACATTGTTTTAACTCAGATAATACCGTTGAAATTACCGCGTTAATTTCATCTTCTTCAAGGGTTTTTTCATTATCTTGAATTACTAAGCTGATAGCTAAGCTCTTATGCCCTGCAGCAACACCGGTTCCGTGGTAAACATCAAATAAATTGATTTGGGTTAATTTATC > 1/1494567‑1495042 | aCCTTTTCAACCCGGTTGCGCAATTTTTGTCCCGGTTTGAACACCACCACACGACGGGCAGAAACCGGTACGCTTTCACCGGTTTTCGGGTTTCTACCCGGACGGGAAGCTTTATCACGTAATTCAAAATTACCAAAACCAGATAATTTCACGTCATTTCCTGTTTCCAAAGCCACACGGATTTCTTCAAAAAAGCTTTCGACCAAATCCTTTGCCTCACGTTTACTGAGATGGAATTTCTCAATAAGAt < 1:540544/250‑1 (MQ=255) 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tCCTTTGCCTCACGTTTACTGAGATGGAATTTCTCAATAAGATTTTCGGCGAGTTCTACTTTAGTTAATGTCATAGTTTAATCTCTCAAATAAGCATTAAAACATTGTTTTAACTCAGATAATACCGTTGAAATTACCGCGTTAATTTCATCTTCTTCAAGGGTTTTTTCATTATCTTGAATTACTAAGCTGATAGCTAAGCTCTTATGCCCTGCAGCAACACCGGTTCCGTGGTAAACATCAAATAAAtt > 1:847134/1‑251 (MQ=255) gCCTCACGTTTACTGAGATGGAATTTCTCAATAAGATTTTCGGCGAGTTCTACTTTAGTTAATGTCATAGTTTAATCTCTCAAATAAGCATTAAAACATTGTTTTAACTCAGATAATACCGTTGAAATTACCGCGTTAATTTCATCTTCTTCAAGGGTTTTTTCATTATCTTGAATTACTAAGCTGATAGc > 1:159490/1‑191 (MQ=255) cACGTTTACTGAGATGGAATTTCTCAATAAGATTTTCGGCGAGTTCTACTTTAGTTAATGTCATAGTTTAATCTCTCAAATAAGCATTAAAACATTGTTTTAACTCAGATAATACCGTTGAAATTACCGCGTTAATTTCAtct > 1:217612/1‑143 (MQ=255) cGTTTACTGAGATGGAATTTCTCAATAAGATTTTCGGCGAGTTCTACTTTAGTTAATGTCATAGTTTAATCTCTCAAATAAGCATTAAAACATTGTTTTAACTCAGATAATAc > 1:679080/1‑113 (MQ=255) cGTTTACTGAGATGGAATTTCTCAATAAGATTTTCGGCGAGTTCTACTTTAGTTAATGTCATAGTTTAATCTCTCAAATAAGCATTAAAACATTGTTTTAACTCAGATAATACCGTTGAAATTACCGCGTTAATTTCATCTTCTTCAAGGGTTTTTTCATTATCTTGAATTACTAAGCTGATAGCTAAGCTCTTATGccc > 1:898750/1‑200 (MQ=255) cGTTTACTGAGATGGAATTTCTCAATAAGATTTTCGGCGAGTTCTACTTTAGTTAATGTCATAGTTTAATCTCTCAAATAAGCATTAAAACATTGTTTTAACTCAGATAATACCGTTGAAATTACCGCGTTAATTTCATCTTCTTCAAGGGTTTTTTCATTATCTTGAATTACTAAGCTGATAGCTAAGCTCTTATGCCCTGCAGCAACACCGGTTCCGTGGTAAACATCAAATGAATTGATTTGGGTTaa > 1:449742/1‑251 (MQ=255) cGTTTACTGAGATGGAATTTCTCAATAAGATTTTCGGCGAGTTCTACTTTAGTTAATGTCATAGTTTAATCTCTCAAATAAGCATTAAAACATTGTTTTAACTCAGATAATACCGTTGAAATTACCGCGTTAATTTCATCTTCTTCAAGGGTTTTTTCATTATCTTGAATTACTAAGCTGATAGCTAAGCTCTTATGCCCTGCAGCAACACCGGTTCCGTGGTAAACATCAAATAAATTGATTTGGGTTaa > 1:712174/1‑251 (MQ=255) cTGAGATGGAATTTCTCAATAAGATTTTCGGCGAGTTCTACTTTAGTTAATGTCATAGTTTAATCTCTCAAATAAGCATTAAAACATTGTTTTAACTCAGATAATACCGTTGAAATTACCGCGTTAATTTCATCTTCTTCAAGGGTTTTTTCATTATCTTGAATTACTAAGCTGATAGCTAAGCTCTTATGCCCTGCAGCAACACCGGTTCCGTGGTAAACATCAAATAAATTGATTTGGGTTAATTTAtc < 1:478463/251‑1 (MQ=255) | ACCTTTTCAACCCGGTTGCGCAATTTTTGTCCCGGTTTGAACACCACCACACGACGGGCAGAAACCGGTACGCTTTCACCGGTTTTCGGGTTTCTACCCGGACGGGAAGCTTTATCACGTAATTCAAAATTACCAAAACCAGATAATTTCACGTCATTTCCTGTTTCCAAAGCCACACGGATTTCTTCAAAAAAGCTTTCGACCAAATCCTTTGCCTCACGTTTACTGAGATGGAATTTTTCAATAAGATTTTCGGCGAGTTCTACTTTAGTTAATGTCATAGTTTAATCTCTCAAATAAGCATTAAAACATTGTTTTAACTCAGATAATACCGTTGAAATTACCGCGTTAATTTCATCTTCTTCAAGGGTTTTTTCATTATCTTGAATTACTAAGCTGATAGCTAAGCTCTTATGCCCTGCAGCAACACCGGTTCCGTGGTAAACATCAAATAAATTGATTTGGGTTAATTTATC > 1/1494567‑1495042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |