| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,461,690 | T→A | intergenic (+194/‑474) | unknown → / → unknown | FIG00698722: hypothetical protein/Bacterial non‑heme ferritin (EC 1.16.3.2) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,461,690 | 0 | T | A | 100.0% | 56.7 / NA | 21 | intergenic (+194/‑474) | unknown/unknown | FIG00698722: hypothetical protein/Bacterial non‑heme ferritin (EC 1.16.3.2) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (10/11); total (10/11) | |||||||||||
CAGCTATCCAATTTTATTAAGACGGATAAAGGCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACACTTCTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTTCATCACGTTTAACTAGTAATAGTGACCTTTGAATAACTCTGTGTTTTCATTAAATCGTAGTGTTCATTTACTTTGCCACTAATTTCGCATAACATATATTATGTTAAATAAAATAAATGGTAAGTCACTTCTGGGAATTTGAGGTTTGCTCTCTTTAAAAATGACTGGGTAAAAAAATTTATTTCTTGAAGATTTGATTTTTTGAGCGTTTATGATGATGAGATATTCGTGAGTTTTTAGAGGTAGGTGAAAATACTTCTCTAGCTGAATCTAGGTTTATAAAAATCGACTGATATTCATAGAGGGTTTTTATCGTTATGTACATC > 1/1461458‑1461933 | aaatttcccgcccctgcaaatacccctaaagccacgtaataactgctgactagataatgcgatacgtgcttgaatttatgcttacatTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAACATAtatta < 1:358946‑M2/164‑1 (MQ=255) 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CAGCTATCCAATTTTATTAAGACGGATAAAGGCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACACTTCTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTTCATCACGTTTAACTAGTAATAGTGACCTTTGAATAACTCTGTGTTTTCATTAAATCGTAGTGTTCATTTACTTTGCCACTAATTTCGCATAACATATATTATGTTAAATAAAATAAATGGTAAGTCACTTCTGGGAATTTGAGGTTTGCTCTCTTTAAAAATGACTGGGTAAAAAAATTTATTTCTTGAAGATTTGATTTTTTGAGCGTTTATGATGATGAGATATTCGTGAGTTTTTAGAGGTAGGTGAAAATACTTCTCTAGCTGAATCTAGGTTTATAAAAATCGACTGATATTCATAGAGGGTTTTTATCGTTATGTACATC > 1/1461458‑1461933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |