| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,448,626 | C→T | P322S (CCA→TCA) | unknown → | Lysophospholipid transporter LplT / 2‑acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase (EC 2.3.1.40) / Acyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthetase (EC 6.2.1.20) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,448,626 | 0 | C | T | 100.0% | 204.7 / NA | 72 | P322S (CCA→TCA) | unknown | Lysophospholipid transporter LplT / 2‑acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase (EC 2.3.1.40) / Acyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthetase (EC 6.2.1.20) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (39/33); total (39/33) | |||||||||||
GCATTGTCGGATTAAGCATTTTCTGGGGCGTATCACAGGTGATTGTGGCGGCATTTCCGGCACATTACAAAATGCTGTTTAACGATGATAACGCGTTAATCATTCAGATGATTTTAGCCGTCAGCGGCATCGGTTTAATTGTCGGCTCCTACATTGCGGGCGCCATGTCCAAACACCACATTGAATTAGGCATTGTTCCCCTCGGTGCGCTAGGTTTGTTTGTTTCCTTATTTTTCTTAGCGCCATCTACGAATGTAACATTGATTAGCTTCTGTTCTTTCTGTTTCGGTTTATTCGGCGGATTATTTATCGTGCCGTTAAACGCTACCATTCAGTTCTTCGCACCGGAAGCCAAAATGGGGAAAATTATCGCCGGCAATAACTTCATCCAAAACATCGCCATGATCGGCTTTTTGTTGTTAAGTATCGCCTTTGTTTACGCGGATATTTCCACCACAGGCTTATTTATTTTTGTTTCTGTGG > 1/1448384‑1448866 | gCATTGTCGGATTAAGCATTTTCTGGGGCGTATCACAGGTGATTGTGGCGGCATTTCCGGCACATTACAAAATGCTGTTTAACGATGATAACGCGTTAATCATTCAGATGATTTTAGCCGTCAGCGGCATCGGTTTAATTGTCGGCTCCTACATTGCGGGCGCCATGTCCAAACACCACATTGAATTAGGCATTGTTCCCCTCGGTGCGCTAGGTTTGTTTGTTTCCTTATTTTTCTTAGCGTCATCTACg > 1:450661/1‑251 (MQ=255) 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gtttgtttgtttCCTTATTTTTCTTAGCGTCATCTACGAATGTAACATTGATTAGCTTCTGTTCTTTCTGTTTCGGTTTATTCGGCGGATTATTTATCGTGCCGTTAAACGCTACCATTCAGTTCTTCGCACCGGAAGCCAAAATGGGGAAAATTATCGCCGGCAATAACTTCATCCAAAACATCGCCATGATCGGCTTTTTGTTGTTAAGTATCGCCTTTGTTTACGCGGATATTTCCACCACAGGCtta > 1:761810/1‑251 (MQ=255) gtttgtttgtttCCTTATTTTTCTTAGCGTCATCTACGAATGTAACATTGATTAGCTTCTGTTCTTTCTGTTTCGGTTTATTCGGCGGATTATTTATCGTGCCGTTAAACGCTACCATTCAGTTCTTCGCACCGGAAGCCAAAATGGGGAAAATTATCGCCGGCAATAACTTCATCCAAAACATCGCCATGATCGGCTTTTTGTTGTTAAGTATCGCCTTTGTTTACGCGGATATTTCCACCACAGGCtta > 1:476825/1‑251 (MQ=255) tgtttgtttCCTTATTTTTCTTAGCGTCATCTACGAATGTAACATTGATTAGCTTCTGTTCTTTCTGTTTCGGTTTATTCGGCGGATTATTTATCGTGCCGTTAAACGCTACCATTCAGTTCTTCGCACCGGAAGCCAAAATGGGGAAAATTATCGCCGGCAATAACTTCATCCAAAACATCGCCATGATCGGCTTTTTGTTGTTAAGTATCGCCTTTGTTTACGCGGATATTTCCACCACAGGCttattt < 1:11191/251‑1 (MQ=255) 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tCTTAGCGTCATCTACGAATGTAACATTGATTAGCTTCTGTTCTTTCTGTTTCGGTTTATTCGGCGGATTATTTATCGTGCCGTTAAACGCTACCATTCAGTTCTTCGCACCGGAAGCCaaaa < 1:625686/123‑1 (MQ=255) | GCATTGTCGGATTAAGCATTTTCTGGGGCGTATCACAGGTGATTGTGGCGGCATTTCCGGCACATTACAAAATGCTGTTTAACGATGATAACGCGTTAATCATTCAGATGATTTTAGCCGTCAGCGGCATCGGTTTAATTGTCGGCTCCTACATTGCGGGCGCCATGTCCAAACACCACATTGAATTAGGCATTGTTCCCCTCGGTGCGCTAGGTTTGTTTGTTTCCTTATTTTTCTTAGCGCCATCTACGAATGTAACATTGATTAGCTTCTGTTCTTTCTGTTTCGGTTTATTCGGCGGATTATTTATCGTGCCGTTAAACGCTACCATTCAGTTCTTCGCACCGGAAGCCAAAATGGGGAAAATTATCGCCGGCAATAACTTCATCCAAAACATCGCCATGATCGGCTTTTTGTTGTTAAGTATCGCCTTTGTTTACGCGGATATTTCCACCACAGGCTTATTTATTTTTGTTTCTGTGG > 1/1448384‑1448866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |