| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,424,400 | A→G | N78D (AAT→GAT) | unknown → | Esterase/lipase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,424,400 | 0 | A | G | 100.0% | 179.8 / NA | 68 | N78D (AAT→GAT) | unknown | Esterase/lipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (42/26); total (42/26) | |||||||||||
GATTTGACCGCACTTTCTAAAGGCTATGTGGTGGCGAGTGTGGGCGCACGCGGGCGGACGCTGGAGAAAGACGGAAAATATACCGGCAAGGCGCCGGCGGCGATTATCGATTTGAAATCGGCGGTGCGTTATTTGCATTTTAATGATGAGGTGATGCCGGGCGATGCCAATAAAATTATTTCTAATGGCACCAGTGCCGGCGGGGCGTTGTCCGCCTTGTTAGGGGCGAGCGGCAATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCTGCCTATTGTCCGATTACCAATTTGGAGCACGCCGATAGCGCTTATGAATGGGAGTTTAACGGTTTAAACGAATATCGCCGTATGGATATGAGTCGTTTAAATGCGGACAGTTATAACGATCGTTCTCAAGCAGCGGCAAAAGCGACCATTGACGGCA > 1/1424166‑1424631 | gATTTGACCGCACTTTCTAAAGGCTATGTGGTGGCGAGTGTGGGCGCACGCGGGCGGACGCTGGAGAAAGACGGAAAATATACCGGCAAGGCGCCGGCGGCGATTATCGATTTGAAATCGGCGGTGCGTTATTTGCATTTTAATGATGAGGTGATGCCGGGCGATGCCAATAAAATTATTTCTAATGGCACCAGTGCCGGCGGGGCGGTGTCCGCCTTGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATgg > 1:599991/1‑250 (MQ=255)gATTTGACCGCACTTTCTAAAGGCTATGTGGTGGCGAGTGTGGGCGCACGCGGGCGGACGCTGGAGAAAGACGGAAAATATACCGGCAAGGCGCCGGCGGCGATTATCGATTTGAAATCGGCGGTGCGTTATTTGCATTTTAATGATGAGGTGATGCCGGGCGATGCCAATAAAATTATTTCTAATGGCACCAGTGCCGGCGGGGCGGTGTCCGCCCTGTTAGGGGCGAGCGGCGATAAACCGGGTTAtt > 1:51792/1‑249 (MQ=255) cACTTTCTAAAGGCTATGTGGTGGCGAGTGTGGGCGCACGCGGGCGGACGCTGGAGAAAGACGGAAAATATACCGGCAAGGCGCCGGCGGCGATTATCGATTTGAAATCGGCGGTGCGTTATTTGCATTTTAATGATGAGGTGATGCCGGGCGATGCCAATAAAATTATTTCTAATGGCACCAGTGCCGGCGGGGCGTTGTCCGCCTTGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTAttt < 1:669730/250‑1 (MQ=255) ttCTAAAGGCTATGTGGTGGCGAGTGTGGGCGCACGCGGGCGGACGCTGGAGAAAGACGGAAAATATACCGGCAAGGCGCCGGCGGCGATTATCGATTTGAAATCGGCGGTGCGTTATTTGCATTTTAATGATGAGGTGATGCCGGGCGATGCCAATAAAATTATTTCTAATGGCACCAGTGCCGGCGGGGCGTTGTCCTCCTTGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAac < 1:250784/251‑1 (MQ=255) 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gTCCGCCTTGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAg < 1:470842/74‑1 (MQ=255) gCCTTGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCCGCCTATTGTCCGATTACCAATTTGGAGCACGCCGATAGCGCTTATGAATGGGAGTTTAACGGTTTAAACGAATATCGCCGTATGGATATGAGTCGTTTAAATGCGGACAGTTATAAc > 1:24952/1‑213 (MQ=255) ttGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCTGCCTATTGTCCGATTACCAATTTGGAGCACGCCGATAGCGCTTATGAATGGGAGTTTAACGGTTTAAACGAATATCGCCGTATGGATATGAGTCGTTTAAATGCGGACAGTTATAACGATCGTTCTCAAGCAGCGGCAAAAGCGACCATTGACGGCa > 1:538221/1‑250 (MQ=255) tGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCTGcc > 1:304639/1‑95 (MQ=255) tGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCTGCCTATTGTCCGATTACCAAt < 1:494948/113‑1 (MQ=255) tGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCTGCCTATTGTCCGATTACCAATTTGGAGCACGCCGATAGCGCTTATGAATggg > 1:604056/1‑144 (MQ=255) tGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCTGCCTATTGTCCGATTACCAATTTGGAGCACGCCGATAGCGCTTATGAATGGGAGTTTAACGGTTTAAACGAATATCGCCGTATGGATATGAGTCGTTTAAATGCGGACAGTTATaa > 1:789179/1‑208 (MQ=255) tGTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCTGCCTATTGTCCGATTACCAATTTGGAGCACGCCGATAGCGCTTATGAATGGGAGTTTAACGGTTTAAACGAATATCGCCGTATGGATATGAGTCGTTTAAATGCGGACAGTTATAACg > 1:168493/1‑210 (MQ=255) gTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCTGCCTATTGTCCGATTACCAATTTGGAGCACGCCGATAGCGCTTATGAATGGGAGTTTAACGGTTTAAACGAATATCGCCGTATGGATATGAGTCGTTTAAATGCGGACAGTTATaa > 1:846355/1‑207 (MQ=255) gTTAGGGGCGAGCGGCGATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCTGCCTATTGTCCGATTACCAATTTGGAGCACGCCGATAGCGCTTATGAATGGGAGTTTAACGGTTTAAACGAATATCGCCGTATGGATATGAGTCGTTTAAATGCGGACAGTTATaa > 1:196644/1‑207 (MQ=255) | GATTTGACCGCACTTTCTAAAGGCTATGTGGTGGCGAGTGTGGGCGCACGCGGGCGGACGCTGGAGAAAGACGGAAAATATACCGGCAAGGCGCCGGCGGCGATTATCGATTTGAAATCGGCGGTGCGTTATTTGCATTTTAATGATGAGGTGATGCCGGGCGATGCCAATAAAATTATTTCTAATGGCACCAGTGCCGGCGGGGCGTTGTCCGCCTTGTTAGGGGCGAGCGGCAATAATCCGGATTATGCCCATTATTTAAAACACGCGGGCGCGGCAGAAGCGAGTGATGCAATTTTTGCGGTTTCTGCCTATTGTCCGATTACCAATTTGGAGCACGCCGATAGCGCTTATGAATGGGAGTTTAACGGTTTAAACGAATATCGCCGTATGGATATGAGTCGTTTAAATGCGGACAGTTATAACGATCGTTCTCAAGCAGCGGCAAAAGCGACCATTGACGGCA > 1/1424166‑1424631 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |