| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,393,724 | T→C | G182G (GGT→GGC) | unknown → | Possible protease sohB (EC 3.4.21.‑) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,393,724 | 0 | T | C | 100.0% | 166.0 / NA | 59 | G182G (GGT→GGC) | unknown | Possible protease sohB (EC 3.4.21.‑) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (32/27); total (32/27) | |||||||||||
TAAGCCAACTCTTTATGTTTTACATTTTAAAGGGGATATTTCTGCTTCGGAAACAGCAGCGTTAAGAGAGGAAATCAGCGCTATTATTCAAGTTGCCAAACCCACTGATGAAGTTTTGGTATGTTTGGAAAGCCCGGGCGGTGTTGTACATGGCTATGGGCTCGCTGCCTCTCAATTAATGCGTTTGAAACAACGCAACATTAGATTAACCGTTGCCGTGGATAAAGTAGCAGCAAGCGGTGGTTATATGATGGCCTGTGTTGCCGATAAAATTGTATCCGCACCGTTTGCTATTATCGGTTCTATCGGTGTGGTAGCGCAGATTCCAAATGTTCATCGCCTACTAAAAAAACATGATGTGGATGTGGACGTGATGACGGCAGGCGAATATAAACGCACTATGACGATTTTTGGTGAAAATACCGAAAAAGGAAAGCAAAAATTCCAACAGGAATTAGAAGAAACTCATCAGTTA > 1/1393484‑1393958 | tAAGCCAACTCTTTATGTTTTACATTTTAAAGGGGATATTTCTGCTTCGGAAACAGCAGCGTTAAGAGAGGAAATCAGCGCTATTATTCAAGTTGCCAAACCCACTGATGAAGTTTTGGTATGTTTGGAAAGCCCGGGCGGTGTTGTACATGGCTATGGGCTCGCTGCCTCTCAATTAATGCGTTTGAAACAACGCAACATTAGATTAACCGTTGCCGTGGATAAAGTAGCAGCAAGCGGCGGTTATatga < 1:421429/251‑1 (MQ=255) 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TAAGCCAACTCTTTATGTTTTACATTTTAAAGGGGATATTTCTGCTTCGGAAACAGCAGCGTTAAGAGAGGAAATCAGCGCTATTATTCAAGTTGCCAAACCCACTGATGAAGTTTTGGTATGTTTGGAAAGCCCGGGCGGTGTTGTACATGGCTATGGGCTCGCTGCCTCTCAATTAATGCGTTTGAAACAACGCAACATTAGATTAACCGTTGCCGTGGATAAAGTAGCAGCAAGCGGTGGTTATATGATGGCCTGTGTTGCCGATAAAATTGTATCCGCACCGTTTGCTATTATCGGTTCTATCGGTGTGGTAGCGCAGATTCCAAATGTTCATCGCCTACTAAAAAAACATGATGTGGATGTGGACGTGATGACGGCAGGCGAATATAAACGCACTATGACGATTTTTGGTGAAAATACCGAAAAAGGAAAGCAAAAATTCCAACAGGAATTAGAAGAAACTCATCAGTTA > 1/1393484‑1393958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |