| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,391,939 | A→C | L328F (TTA→TTC) | unknown → | NADH dehydrogenase (EC 1.6.99.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,391,939 | 0 | A | C | 100.0% | 163.0 / NA | 54 | L328F (TTA→TTC) | unknown | NADH dehydrogenase (EC 1.6.99.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (28/26); total (28/26) | |||||||||||
TCGGCGTGGATGTAAAGACTAATACGATGATTGTTGAAGCTAAGAAAAAACAATTGGTGACAAAAGATGGTCAGTTAATTCCTGCAGATTTAATCGTGTGGTCGGCAGGCATTCGCACGTCAGCTATTACAAAAAATTTCGATGGTTTGGAAATTAACCGCATCAATCAACTCGTTGTGAAGAAGACATTACAAACTACAAACGATAGTACGATTTTTGCTATGGGGGACTGTTGTTTATTGATGCAAGACGATGGAAAACCGGTTCCGCCTAAGGCGCAGGCAGCCCATCAAATGGCAAGTTTATGTGCGAAAAATATGGTTGCTTTATTTGATAATAAGCCGTTAAAAGACTTTGAATATAATGATAAAGGATCGTTGGTTTCCTTATCGGAATTCACCGCTTTTGGTGCCTTAAGCGGTAAAATCACGGGTGGTTCTTCGATGACCATTGAAGGGAAAATCGCGCAATGGGTATATGTTTCG > 1/1391701‑1392185 | tCGGCGTGGATGTAAAGACTAATACGATGATTGTTGAAGCTAAGAAAAAACAATTGGTGACAAAAGATGGTCAGTTAATTCCTGCAGATTTAATCGTGTGGTCGGCAGGCATTCGCACGTCAGCTATTACAAAAAATTTCGATGGTTTGGAAATTAACCGCATCAATCAACTCGTTGTGAAGAAGACATTACAAACTACAAACGATAGTACGATTTTTGCTATGGGGGACTGTTGTTTCTTGATGCAAGAc < 1:896931/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |