| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 93,470 | C→T | T134T (ACG→ACA) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 93,470 | 0 | C | T | 100.0% | 205.2 / NA | 72 | T134T (ACG→ACA) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (45/27); total (45/27) | |||||||||||
CAAATGTACGGCGCGGCGACAGGCGGCGGGCAATGCGCTGCTCTGCGGCAGTGACGGATTGATGTACAGAGGTCAGCCACTGCAGGTTTTCTGTGACATCCTCGCTCCAATCCGGCATAAACGACCAATCAGTTGAGCGCGAGCCTATAATGCGCAGGGTAACTGCACTTTTACCCAAAAAATTAAAGGTAACCACACAATCAATGGTGGGCGCGCCTTGCATGCCGACGTTAACCGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CC‑ACAACAGACACCGATAAAAGTTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCAAATTTGCACGTTAAAGGTCTGGTCGGTAGAGATTGCACCCAGATTTACCGTGTGCGGGATAACCACAATGCGGCGATATAAATCAAGGTAAAAATTGGGCGTGATATAACCGCCCGATTGGTGCG > 1/93235‑93714 | cAAACGTACGGCGCGGCGACAAGCGGCGGGCAATGCGCTGCTCTGCTGCCGTCACAGATTGATGCACGGAAGTCAGCCACTCCAGATTTTCGGTCACCTCTTGTGACCAGTCCGGCAGAAATGCCCAATCGGTTGAACGCGAGCCTATAATGCGCAGGGTAACCGCACTTTTACCCAAAAAATTAAAGGTAACAACACAATCAATGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAg > 1:743282/1‑250 (MQ=255)cAAACGTACGGCGCGGCGACAAGCGGCGGGCAATGCGCTGCTCTGCTGCCGTCACAGATTGATGCACGGAAGTCAGCCACTCCAGATTTTCGGTCACCTCTTGTGACCAGTCCGGCAGAAATGCCCAATCGGTTGAACGCGAGCCTATAATGCGCAGGGTAACCGCACTTTTACCCAAAAAATTAAAGGTAACAACACAATCAATGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAg > 1:553731/1‑250 (MQ=255) gACAAGCGGCGGGCAATGCGCTGCTCTGCTGCCGTCACAGATTGATGCACGGAAGTCAGCCACTCCAGATTTTCGGTCACCTCTTGTGACCAGTCCGGCAGAAATGCCCAATCGGTTGAACGCGAGCCTATAATGCGCAGGGTAACCGCACTTTTACCCAAAAAATTAAAGGTAACAACACAATCAATGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAatat > 1:748436/1‑251 (MQ=255) aaTGCGCTGCTCTGCTGCCGTCACAGATTGATGCACGGAAGTCAGCCACTCCAGATTTTCGGTCACCTCTTGTGACCAGTCCGGCAGAAATGCCCAATCGGTTGAACGCGAGCCTATAATGCGCAGGGTAACCGCACTTTTACCCAAAAAATTAAAGGTAACAACACAATCAATGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGcc < 1:689940/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aatcaatGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CG‑ACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCGAAGCTCTGCTCGGTTGAGAtt > 1:447033/1‑191 (MQ=255) aatcaatGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CG‑ACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGGGATTGCACCCAGa > 1:770884/1‑200 (MQ=255) caatGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CG‑ACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACgccaaagctc > 1:37569/1‑164 (MQ=255) atGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CG‑ACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTAAAAAttcgg > 1:151433/1‑248 (MQ=255) 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gACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CG‑ACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTAAAAATTCGGCGTGATATAACCGCCCGATTgg > 1:638576/1‑250 (MQ=255) gACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CG‑ACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTAAAAATTCGGCGTGATATAACCGCCCGATTgg > 1:297105/1‑250 (MQ=255) cGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CG‑ACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTAAAAATTCGGCGTGATATAACCg > 1:744435/1‑239 (MQ=255) cGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CG‑ACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTAAAAATTCGGCGTGATATAACCGCCCGATTggcgg > 1:559087/1‑248 (MQ=255) ttAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CG‑ACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTAAAAATTCGGCGTGATATAACCGCCCGATTggcggg < 1:389224/250‑5 (MQ=255) tAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CG‑ACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTAAAAATTCGGCGTGATATAACCg > 1:726682/1‑236 (MQ=255) | CAAATGTACGGCGCGGCGACAGGCGGCGGGCAATGCGCTGCTCTGCGGCAGTGACGGATTGATGTACAGAGGTCAGCCACTGCAGGTTTTCTGTGACATCCTCGCTCCAATCCGGCATAAACGACCAATCAGTTGAGCGCGAGCCTATAATGCGCAGGGTAACTGCACTTTTACCCAAAAAATTAAAGGTAACCACACAATCAATGGTGGGCGCGCCTTGCATGCCGACGTTAACCGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCAC‑‑CC‑ACAACAGACACCGATAAAAGTTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCAAATTTGCACGTTAAAGGTCTGGTCGGTAGAGATTGCACCCAGATTTACCGTGTGCGGGATAACCACAATGCGGCGATATAAATCAAGGTAAAAATTGGGCGTGATATAACCGCCCGATTGGTGCG > 1/93235‑93714 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |