| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 93,448 | C→A | A142S (GCG→TCG) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 93,448 | 0 | C | A | 100.0% | 188.4 / NA | 64 | A142S (GCG→TCG) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (37/27); total (37/27) | |||||||||||
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caatcaatGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCACCGACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTaaaa > 1:246385/1‑251 (MQ=255) caatcaatGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCACCGACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTaaaa > 1:35172/1‑251 (MQ=255) aatcaatGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCTTCTAACTTAATCCCCTCACCACCGACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACcagg > 1:328955/1‑222 (MQ=255) aatcaatGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCACCGACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCac > 1:472068/1‑157 (MQ=255) aatcaatGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCACCGACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCGAAGCTCTGCTCGGTTGAGAtt > 1:447033/1‑191 (MQ=255) aatcaatGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCACCGACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGGGATTGCACCCAGa > 1:770884/1‑200 (MQ=255) caatGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCACCGACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACgccaaagctc > 1:37569/1‑164 (MQ=255) atGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCACCGACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTAAAAAttcgg > 1:151433/1‑248 (MQ=255) atGGTGGGCGAGCCCTGCATGCCGACGTTAACTGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCACCGACAACAGACACCGATAAAAGCTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCACACTTGCACGCCAAAGCTCTGCTCGGTTGAGATTGCACCCAGATTTACCGTATGGGGAATAACCAGGATGCGCCGATATAAATCCAGGTAAAAAttcgg > 1:493737/1‑248 (MQ=255) | TCAACATCGCCGAAACTTACTTTAAACTCAAATGTACGGCGCGGCGACAGGCGGCGGGCAATGCGCTGCTCTGCGGCAGTGACGGATTGATGTACAGAGGTCAGCCACTGCAGGTTTTCTGTGACATCCTCGCTCCAATCCGGCATAAACGACCAATCAGTTGAGCGCGAGCCTATAATGCGCAGGGTAACTGCACTTTTACCCAAAAAATTAAAGGTAACCACACAATCAATGGTGGGCGCGCCTTGCATGCCGACGTTAACCGTCCATTTTTTAAGCGCCAGCGGGTTAAATATGCCTGATGTCGGCCCCTCTAACTTAATCCCCTCACCACCCACAACAGACACCGATAAAAGTTTGACCGCGCTGCGGTTGGCGTTCCAAATTTGCACGTTAAAGGTCTGGTCGGTAGAGATTGCACCCAGATTTACCGTGTGCGGGATAACCACAATGCGGCGATATAAATCAAGGTAAAAATTGGG > 1/93207‑93688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |