| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,190,743 | A→C | intergenic (‑189/+36) | unknown ← / ← unknown | GTP cyclohydrolase 1 type 2 homolog YbgI/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase (EC 4.3.99.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,190,743 | 0 | A | C | 100.0% | 70.2 / NA | 26 | intergenic (‑189/+36) | unknown/unknown | GTP cyclohydrolase 1 type 2 homolog YbgI/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase (EC 4.3.99.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (14/12); total (14/12) | |||||||||||
CTGCTGAGCTTTTGATTAAGTAGATTTTCCAGGGCTAAATTTTGCATAACTATTCTCTGAATAAAGAAAGGAATGGCGTAATGATAATGGCTTTGGGGAGGAATAAGAAGAAAAAAATGACCGGTGCAAAGATCTTTTGGTAAAGACATGGGGGAGTTGTTTGCACCGGCCACTGTGTTTAAGAATGACGACCACCTTAAATAAAAACAGCTTCATTATACAATTTAATATATAGAGATCAAGTAAAATCTGCTTATTTCGTTAAAAAAATTTATTCAATGCCAATTAATTTATGTGTTTGTACACTTAATAACCATTTTGGTCTGTTTACACGTTGATTTAATTGCCCAAGTTGGGTGATGGTTTCCAGCAAATTCATTTTGCCGTTAATTTCACAAGGAGAAAGGTAATAGCGCTCGGCGCGGATTTTGTCTTCAATAAGTTCACAAAATGCCATAACGTTTTCATCTGCAACGA > 1/1190508‑1190984 | ctgctgAGCTTTTGATTAAGTAGATTTTCCAGGGCTAAATTTTGCATAACTATTCTCTGAATAAAGAAAGGAATGGCGTAATGATAATGGCTTTGGGGAGGAATAAGAAGAAAAAAATGACCGGTGCGAAGATCTTTTGGTAAAGACATGGGGGAGTTGTTTGCACCGGCCACTGTGTTTAAGAATGACGACCACCTTAAATAAAAACAGCTTCATTATACAATTTAATATATAGCGATCAAGTAAAAt > 1:726088/1‑249 (MQ=255) 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1:737327/1‑251 (MQ=255) aaTATATAGCGATCAAGTAAAATCTGCTTATTTCGTTAAAAAAATTTATTCAATGCCAATTAATTTATGTGTTTGTACACTTAATAACCATTTTGGTCTGTTTACACg > 1:767051/1‑108 (MQ=255) aaTATATAGCGATCAAGTAAAATCTGCTTATTTCGTTAAAAAAATTTATTCAATGCCAATTAATTTATGTGTTTGTACACTTAATAACCATTTTGGTCTGTTTACACGTTGATTTAATTGCCCAAGTTGGGTGATGGTTTCCAGCAAATTCATTTTGCCGTTAATTTCACAAGGAGAAAGGTAATAg < 1:172479/187‑1 (MQ=255) aaTATATAGCGATCAAGTAAAATCTGCTTATTTCGTTAAAAAAATTTATTCAATGCCAATTAATTTATGTGTTTGTACACTTAATAACCATTTTGGTCTGTTTACACGTTGATTTAATTGCCCAAGTTGGGTGATGGTTTCCAGCAAATTCATTTTGCCGTTAATTTCACAAGGAGAAAGGTAATAGCGCTCGGCGCGGATTTTGTCTTCAATAAGTTCACAAAATGCCATAACGTTTTCATCTGCAACGa > 1:499283/1‑251 (MQ=255) aaTATATAGCGATCAAGTAAAATCTGCTTATTTCGTTAAAAAAATTTATTCAATGCCAATTAATTTATGTGTTTGTACACTTAATAACCATTTTGGTCTGTTTACACGTTGATTTAATTGCCCAAGTTGGGTGATGGTTTCCAGCAAATTCATTTTGCCGTTAATTTCACAAGGAGAAAGGTAATAGCGCTCGGCGCGGATTTTGTCTTCAATAAGTTCACAAAATGCCATAACGTTTTCATCTGCAACGa > 1:112975/1‑251 (MQ=255) | CTGCTGAGCTTTTGATTAAGTAGATTTTCCAGGGCTAAATTTTGCATAACTATTCTCTGAATAAAGAAAGGAATGGCGTAATGATAATGGCTTTGGGGAGGAATAAGAAGAAAAAAATGACCGGTGCAAAGATCTTTTGGTAAAGACATGGGGGAGTTGTTTGCACCGGCCACTGTGTTTAAGAATGACGACCACCTTAAATAAAAACAGCTTCATTATACAATTTAATATATAGAGATCAAGTAAAATCTGCTTATTTCGTTAAAAAAATTTATTCAATGCCAATTAATTTATGTGTTTGTACACTTAATAACCATTTTGGTCTGTTTACACGTTGATTTAATTGCCCAAGTTGGGTGATGGTTTCCAGCAAATTCATTTTGCCGTTAATTTCACAAGGAGAAAGGTAATAGCGCTCGGCGCGGATTTTGTCTTCAATAAGTTCACAAAATGCCATAACGTTTTCATCTGCAACGA > 1/1190508‑1190984 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |