| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,154,288 | A→C | K158Q (AAG→CAG) | unknown → | Large extracellular alpha‑helical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,154,288 | 0 | A | C | 100.0% | 247.3 / NA | 81 | K158Q (AAG→CAG) | unknown | Large extracellular alpha‑helical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (47/34); total (47/34) | |||||||||||
AGTAAAAAGCGAAATCACCCAGGGTATAAAAATGGAACCTGCCATTGAGGGGAAATGGATCTGGTCAAGCGACTATTTGCTTAGCTTTACCCCGACGCAGGATTGGCCGACAGGGCAAGAATATAAAATTACCTTGGATAAGAAAGTATTAAATCCAAGTTTGACTTACGCGAAATCCGTTACGGATACCCATTCCGTGAAAACTCAGCCTTTTAGTGTGGTGGAATCCGAATCGGAATTTTATAAGGATCCGAATTTATCCCATATTCGCCATGCGTTGACTCATTTGGTGTTTTCCAACCCGGTGGATCCGAAAGATTTGGAAAAAGCGGTTGAAGTGAACTTGGTGCATAAAAATCAAGATCAGTCGCTGAATTTGATTAACCCGTTGAAATTTAAAATTCGTTATTCCGATAATAAGCTGGAAGCTTGGATTAGGTCCGATGAACTTTCTTTGTCCACCCAGCCGAATCAATTTGTACAGACCAAAA > 1/1154044‑1154534 | aGTAAAAAGCGAAATCACCCAGGGTATAAAAATGGAACCTGCCATTGAGGGGAAATGGATCTGGTCAAGCGACTATTTGCTTAGCTTTACCCCGACGCAGGATTGGCCGACAGGGCAAGAATATAAAATTACCTTGGATAAGAAAGTATTAAATCCAAGTTTGACTTACGCGAAATCCGTTACGGATACCCATTCCGTGAAAACTCAGCCTTTTAGTGTGGTGGAATCCGAATCGGAATTTTATCAGGAt > 1:735115/1‑250 (MQ=255) 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cGTGAAAACTCAGCCTTTTAGTGTGGTGGAATCCGAATCGGAATTTTATCAGGATCCGAATTTATCCCATATTCGCCATGCGTTGACTCATTTGGTGTTTTCCAACCCGGTGGATCCGAAAGATTTGGAAAAAGCGGTTGAAGTGAACTTGGTGCATAAAAATCAAGATc > 1:713378/1‑170 (MQ=255) cTCAGCCTTTTAGTGTGGTGGAATCCGAATCGGAATTTTATCAGGATCCGAATTTATCCCATATTCGCCATGCGTTGACTCATTTGGTGTTTTCCAACCCGGTGGATCCGAAAGATTTGGAAAAAGCGGTTGAAGTGAACTTGGTGCATAAAAATCAAGATCAGTCGCTGAATTTGATTAACCCGTTGAAATTTAAAATTCGTTATTCCGATAATAAGCTGGAAGCTTGGATTAGGTCCGATGAActttct < 1:434239/251‑1 (MQ=255) cTCAGCCTTTTAGTGTGGTGGAATCCGAATCGGAATTTTATCAGGATCCGAATTTATCCCATATTCGCCATGCGTTGACTCATTTGGTGTTTTCCAACCCGGTGGATCCGAAAGATTTGGAAAAAGCGGTTGAAGTGAACTTGGTGCATAAAAATCAAGATCAGTCGCTGAATTTGATTAACCCGTTGAAATTTAAAATTCGTTATTCCGATAATAAGCTGGAAGCTTGGATTAGGTCCGATGAActtt > 1:594771/1‑249 (MQ=255) gCCTTTTAGTGTGGTGGAATCCGAATCGGAATTTTATCAGGATCCGAATTTATCCCATATTCGCCATGCGTTGACTCATTTGGTGTTTTCCAACCCGGTGGATCCGAAAGATTTGGAAAAAGCGGTTGAAGTGAACTTGGTGCATAAAAATCAAGATCAGTCGCTGAATTTGATTAACCCGTTGAAATTTAAAATTCGTTATTCCGATAATAAGCTGGAAGCTTGGAtt > 1:438872/1‑229 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(MQ=255) ggtggAATCCGAATCGGAATTTTATCAGGATCCGAATTTATCCCATATTCGCCATGCGTTGACTCATTTGGTGTTTTCCAACCCGGTGGATCCGAAAGATTTGGAAAAAGCGGTTGAAGTGAACTTGGTGCATAAAAATCAAGATCAGTCGCTGAATTTGATTAACCCGTTGAAATTTAAAATTCGTTATTCCGATAATAAGCTGGAAGCTTGGAtt > 1:431957/1‑217 (MQ=255) aaTCCGAATCGGAATTTTATCAGGATCCGAATTTATCCCATATTCGCCATGCGTTGACTCATTTGGTGTTTTCCAACCCGGTGGATCCGAAAGATTTGGAAAAAGCGGTTGAAGTGAACTTGGTGCATAAAAATCAAGATCAGTCGCTGAATTTGATTAACCCGTTGAAATTTAAAATTCGTTATTCCGATAATAAGCTGGAAGCTTGGATTAGGTCCGATGAACTTTCTTTGTCCACCCAGCCGAATCa < 1:209567/250‑1 (MQ=255) aTCGGAATTTTATCAGGATCCGAATTTATCCCATATTCGCCATGCGTTGACTCATTTGGTGTTTTCCAACCCGGTGGATCCGAAAGATTTGGAAAAAGCGGTTGAAGTGAACTTGGTGCATAAAAATCAAGATCAGTCGCTGAATTTGATTAACCCGTTGAAATTTAAAATTCGTTATTCCGATAATAAGCTGGAAGCTTGGATTAGGTCCGATGAACTTTCTTTGTCCACCCAGCCGAATCAATTTGTAc < 1:106753/251‑1 (MQ=255) 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ttATCAGGATCCGAATTTATCCCATATTCGCCATGCGTTGACTCATTTGGTGTTTTCCAACCCGGTGGATCCGAAAGATTTGGAAAAAGCGGTTGAAGTGAACTTGGTGCATAAAAATCAAGATCAGTCGCTGAATTTGATTAACCCGTTGAAATTTAAAATTCGTTATTCCGATAATAAGCTGGAAGCTTGGATTAGGTCCGATGAACTTTCTTTGTCCACCCAGCCGAATCAATTTGTACAGACCaaaa > 1:761405/1‑251 (MQ=255) | AGTAAAAAGCGAAATCACCCAGGGTATAAAAATGGAACCTGCCATTGAGGGGAAATGGATCTGGTCAAGCGACTATTTGCTTAGCTTTACCCCGACGCAGGATTGGCCGACAGGGCAAGAATATAAAATTACCTTGGATAAGAAAGTATTAAATCCAAGTTTGACTTACGCGAAATCCGTTACGGATACCCATTCCGTGAAAACTCAGCCTTTTAGTGTGGTGGAATCCGAATCGGAATTTTATAAGGATCCGAATTTATCCCATATTCGCCATGCGTTGACTCATTTGGTGTTTTCCAACCCGGTGGATCCGAAAGATTTGGAAAAAGCGGTTGAAGTGAACTTGGTGCATAAAAATCAAGATCAGTCGCTGAATTTGATTAACCCGTTGAAATTTAAAATTCGTTATTCCGATAATAAGCTGGAAGCTTGGATTAGGTCCGATGAACTTTCTTTGTCCACCCAGCCGAATCAATTTGTACAGACCAAAA > 1/1154044‑1154534 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |