| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,022,634 | T→G | G376G (GGT→GGG) | unknown → | Probable sugar efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,022,634 | 0 | T | G | 100.0% | 182.2 / NA | 61 | G376G (GGT→GGG) | unknown | Probable sugar efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (29/32); total (29/32) | |||||||||||
GTCAAAATCAAATCGCCATGTTCCTGTTGGCGTTTATTTGGGGCGTAGGCATTTCCGGTATCGGTTTAAGTTTGCAGGTGCGGGTGTTGCAACTGGCACCTGATGCCACCGATGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGTTTGATGTTGTTTGTGTCTATCCATTTTCGTTATGGAAAAGCTAGTAGCGAAAATTTAACGCATTTATAATGAACCGAATTATTCATTAATAGATTAGAGAATATAAAAGTGCGGTGATTTTCCACCGCACTTTTTGCTTTATCTTTTCGCTTTCTTAATAAACTTCATCAAACGTTTACGCTTACGTAATTGGTTCGGTGTGAGTTTATTGCGTCTGCCGGCAAACGGG > 1/1022390‑1022863 | gTCAAAATCAAATCGCCATGTTCCTGTTGGCGTTTATTTGGGGCGTAGGCATTTCCGGTATCGGTTTAAGTTTGCAGGTGCGGGTGTTGCAACTGGCACCTGATGCCACCGATGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGAtg > 1:729909/1‑251 (MQ=255)gTCAAAATCAAATCGCCATGTTCCTGTTGGCGTTTATTTGGGGCGTAGGCATTTCCGGCATCGGTTTAAGTTTGCAGGTGCGGGTGTTGCAACTGGCACCTGATGCCACCGATGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGAATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCACGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGAtg > 1:335598/1‑251 (MQ=255) cATGTTCCTGTTGGCGTTTATTTGGGGCGTAGGCATTTCCGGTATCGGTTTAAGTTTGCAGGTGCGGGTGTTGCAACTGGCACCTGATGCCACCGATGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGATGTTGTTTGTGTCTATcc < 1:836699/251‑1 (MQ=255) ccTGTTGGCGTTTATTTGGGGCGTAGGCATTTCCGGTATCGGTTTAAGTTTGCAGGTGCGGGTGTTGCAACTGGCACCTGATGCCACCGATGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGATGTTGTTTGTGTCTATCCAtttt > 1:184880/1‑250 (MQ=255) 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tGGCACCTGATGCCACCGATGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGATGTTGTTTGTGTCTATCCATTTTCGTTATGGAAAAGCTAGTAGCGAAAATTTAACGCATTTATAATGAACCGAATTATTCATTAATAGATTagag < 1:23992/251‑1 (MQ=255) ggCACCTGATGCCACCGATGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGATGTTGTTTGTGTCTATCCATTTTCGTTATGGAAAAGCTAGTAGCGAAAATTTAACGCATTTATAATGAACCGAATTATTCATTAATAGATTAgaga > 1:17102/1‑251 (MQ=255) gCACCTGATGCCACCGATGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGATGTTGTTTGTGTCTATCCATTTTCGTTATGGAAAAGCTAGTAGCGAAAATTTAACGCATTTATAATGAACCGAATTATTCATTAATAGATTAgaga < 1:271923/250‑1 (MQ=255) ccTGATGCCACCGATGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGATGTTGTTTGTGTCTATCCATTTTCGTTATGGAAAAGCTAGTAGCGAAAATTTAACGCATTTATAATGAACCGAATTATTCATTAATAGATTAGAGAatat < 1:62065/251‑1 (MQ=255) aTGCCACCGATGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGATGTTGTTTGTGTCTATCCATTTTCGTTATGGAAAAGCTAGTAGCGAAAATTTAACGCATTTATAATGAACCGAATTATTCATTAATAGATTAGAGAATATaaa < 1:566884/250‑1 (MQ=255) aTGTGGCAATGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGATGTTGTTTGTGTc > 1:338684/1‑151 (MQ=255) aTGGCGATTTATTCGGGGCTTTATAATATCGGTATTGGCGGCGGCGCATTATTAGGCAACCAAGTCATGCAACATCTCGGACTTGCCAACATCGGCTTCTCAGGCGCCTTGTTTGCAGCGCTTGGGTTGATGTTGTTTGTGTCTATCCATTTTCGTTATGGAAAAGCTAGTAGCGAAAATTTAACGCATTTATAATGAACCGAATTATTCATTAATAGATTAGAGAATATAAAAGTGCGGTGATTTTCCAc < 1:31234/251‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |