| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1204940 | 1206849 | 1910 | 24 [19] | [22] 28 | unknown–[unknown] | unknown,unknown,unknown,[unknown] |
AAATTAGAAAAAAAGCGGCTAAATTTAAAAATGTGCAATTTAACCACTTAATTTAAGAAATTTAAAGAAAGGCTTTAAAAAGTGTTTAAAAATCGTTTAAAGCCCGTTTAAATAAGGTTTTTCCCGATGTGTACGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCCGCCTCTTGTTGGGTTAAATGGATCGGTGGGCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAAGCCATCCCAGTTGATTTTAACGCGTTTAACCCATACGCTGGCGCCATTTTGCACTAAGTAAATCTTATCGCCTTTAATCTCTTTCTTTAAT > 1/1204689‑1204999 | aaagttagttttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAAcc < 1:131576‑M2/60‑1 (MQ=255)aaagttagttttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAAcc < 1:869468‑M2/60‑1 (MQ=255)aaagttagttttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAAcc < 1:371631‑M2/60‑1 (MQ=255)aaagttagttttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATCGATTTTAACGCGCTTAAcc < 1:105680‑M2/60‑1 (MQ=255) tagttttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATAc < 1:500973‑M2/65‑1 (MQ=255) ttttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGc < 1:226887‑M2/67‑1 (MQ=255) ttagaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTgg < 1:554379‑M2/70‑1 (MQ=255) gaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAAcc < 1:12802‑M2/60‑1 (MQ=255) gaaaaaaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTGgcg > 1:169566‑M2/179‑250 (MQ=255) aaagtggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagctcgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTggcgccgttc < 1:438476‑M2/78‑5 (MQ=255) ggctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATAcgctggcgccgttctgta > 1:866388‑M2/169‑242 (MQ=255) gctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATacgctggcgccgttctgtac < 1:398859‑M2/83‑10 (MQ=255) gctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATacgctggcgccgttctgtac < 1:811454‑M2/83‑10 (MQ=255) gctaaaatctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATacgctggcgccgttctgtac < 1:837640‑M2/83‑10 (MQ=255) atctaaaaagggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATacgctggcgccgttctgtac < 1:899699‑M2/83‑10 (MQ=255) ggcggttttagccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTaacgcgcttaacccatacgctggcgccgttctgtaccaaatagattttatcg < 1:598048‑M2/99‑26 (MQ=255) ccacttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATacgctggcgccgttctgtac < 1:565327‑M2/83‑10 (MQ=255) cttaattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggttgttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATacgctggcgccgttctgtac < 1:542837‑M2/83‑10 (MQ=255) taattgtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGcttaacccatacgctggcgccgttctgtaccaaatagatt > 1:355366‑M2/136‑209 (MQ=255) gtagaaaaacaaaaaggcgtttaaaaaacgtttaaagcccgtttaaataaggtttttcccgatgtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCa > 1:64992‑M2/131‑192 (MQ=255) gtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTGgcgc > 1:437355‑M2/68‑140 (MQ=255) gtgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTGGCGCCGTTCTGTACCAAATAGATTTTATCGCCTTTAATCtcttt > 1:178073‑M2/68‑180 (MQ=255) cgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtgggtatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTggcgccgttc > 1:313664‑M2/63‑136 (MQ=255) cgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattggtggatatTCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAACCCGTCCCAATTGATTTTAACGCGCTTAACCCATACGCTGGCGCCGTTCTGTACCAAATAGATTTTATCGCCTTTAAtctctttctttgat < 1:263522‑M2/120‑4 (MQ=255) | AAATTAGAAAAAAAGCGGCTAAATTTAAAAATGTGCAATTTAACCACTTAATTTAAGAAATTTAAAGAAAGGCTTTAAAAAGTGTTTAAAAATCGTTTAAAGCCCGTTTAAATAAGGTTTTTCCCGATGTGTACGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCCGCCTCTTGTTGGGTTAAATGGATCGGTGGGCTTCTTTATTGTCTGAAATGAGCTCTAAGCCATCCCAGTTGATTTTAACGCGTTTAACCCATACGCTGGCGCCATTTTGCACTAAGTAAATCTTATCGCCTTTAATCTCTTTCTTTAAT > 1/1204689‑1204999 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |