| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | 1 | 89,708 | (TATAT)2→1 | intergenic (‑81/+19) | unknown ← / ← unknown | hypothetical protein/hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
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| ? | 1 | = 89698 | 5 (0.060) | intergenic (‑71/+33) | unknown/unknown | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
ACCAGTAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGACGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTAGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACCACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACTCCCTCGGTTTTGCAGATTGCGTCGAATTCATCTACCACTTCCGGGCGGAGTTTGAACAATACCTGTTTATAGTTGTCTTTGCTGTAGCTGTTAGCGTTTGTGCTAATCGCTTTTTTAGTGTTTTGTGTAAGTCGTTTATAGCGCATTTAAACC > 1/89452‑89944 | aCCAGTAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatat > 1:751454‑M2/1‑247 (MQ=255) 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gcacattctctcgaatagtcatcatacccgctttcttcgcatgcgattaaagcgtaatctgcagcgataatgtccgcaatgtcatcacgattatttacataatcagctacacttttgattgtatgaaagatttcaaatcttaaaggtgttttttcatatttttgagttgtcatttttgtatctcctgccgcgCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGGTTAatattata < 1:645656‑M1/59‑1 (MQ=255) tAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCTCTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatat > 1:316130‑M2/1‑242 (MQ=255) tAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatat > 1:516013‑M2/1‑242 (MQ=255) 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ctcgaatagtcatcatacccgctttcttcgcatgcgattaaagcgtaatctgcagcgataatgtccgcaatgtcatcacgattatttacataatcagctacacttttgattgtatgaaagatttcaaatcttaaaggtgttttttcatatttttgagttgtcatttttgtatctcctgccgcgCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGGTTAatattatat < 1:566098‑M1/60‑1 (MQ=255) cGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataac > 1:333273‑M2/1‑234 (MQ=255) cTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataacta > 1:785611‑M2/1‑232 (MQ=255) cTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatat < 1:888594‑M2/241‑10 (MQ=255) cTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatat < 1:433181‑M2/241‑10 (MQ=255) gTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGATGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataacta > 1:150251‑M2/1‑230 (MQ=255) 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(MQ=255) gTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaagtcgacggaacatctccgctcttgatactccctcggttttgcagattgcgtcgaattcatctaccacttc < 1:462639‑M2/250‑130 (MQ=255) ttGATGTTGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaag < 1:237245‑M2/169‑61 (MQ=255) tcttaaaggtgttttttcatatttttgagttgtcatttttgtatctcctgccgcgCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGGTTAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACGACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAGGGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACTCCCTCGGTTTTGCAg < 1:438944‑M1/159‑1 (MQ=255) tcttaaaggtgttttttcatatttttgagttgtcatttttgtatctcctgccgcgCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGGTTAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACGACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAGAGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACTCCCTCGGTTTTGCAGATTGCGTCGAATTCATCGACCACTTCCGGGc > 1:7484‑M1/56‑245 (MQ=255) ttGCTGGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaagtcgacggaacatctccgctcttgatactccctcggttttgcagattgcgtcgaattcatctaccacttccgggcggagtttgaacaa > 1:170054‑M2/1‑103 (MQ=255) ttcatatttttgagttgtcatttttgtatctcctgccgcgCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGGTTAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACGACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAGAGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACt > 1:852092‑M1/41‑184 (MQ=255) gtagtaAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatat < 1:63475‑M2/95‑10 (MQ=255) tttttgagttgtcatttttgtatctcctgccgcgCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGGTTAatat > 1:759916‑M1/35‑89 (MQ=255) aaGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaagtcgacggaacatctccgctcttgatactccctcggttttgcagattgcgtcgaattcatctaccacttccgggcggagtttgaacaatacctgtttatagttctctttgc > 1:451960‑M2/1‑81 (MQ=255) atctcctgccgcgCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGGTTAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACGACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAGAGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACTCCCTCGGTTTTGCAGATTGCGTCGAATTCATCGACCACTTCCGGGCGGAGTTTGAACAATACCTGTTTATAGTTGTCTTTGCTGTAGCTGTTAg < 1:622855‑M1/238‑1 (MQ=255) ccTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaagtcgacggaacatctccgctcttgatactccctcggttttgcagattgcgtcgaattcatctaccacttccgggcggagtttgaacaatacctgtttatagttctctttgctgtagctgttagcatttgtgc > 1:773015‑M2/1‑60 (MQ=255) ccGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaagtcgacggaacatctccgctcttgatactccctcggttttgcagattgcgtcgaattcatctaccacttccgggcggagtttgaacaatacctgtttatagttctctttgctgtagctgttagcatttgtgctaat > 1:269024‑M2/1‑56 (MQ=255) 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ccTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaagtcgacggaacatctccgctcttgatactccctcggttttgcagattgcgtcgaattcatctaccacttccgggcggagtttgaacaatacctgtttatagttctctttgctgtagctgttagcatttgtgctaatcgcttttttagtgttttgtgtaagtcgtttatagcc < 1:630276‑M2/250‑232 (MQ=255) cGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaagtcgacggaacatctccgctcttgatactccctcggttttgcagattgcgtcgaattcatctaccacttccgggcggagtttgaacaatac < 1:453671‑M2/158‑151 (MQ=255) ggttAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACGACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAGAGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACTCCCTCGGTTTTGCAGATTGCGTCGAATTCATCGACCACTTCCGGGCGGAGTTTGAACAATACCTGTTTATAGTTGTCTTTGCTGTAGCTGTTAGCGTTTGTGCTAATCGCTTTTTTGGTGTTTTGTGTAAGTCGTTtat > 1:771958/3‑237 (MQ=255) ggttAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACGACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAGAGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACTCCCTCGGTTTTGCAGATTGCGTCGAATTCATCGACCACTTCCGGGCGGAGTTTGAACAATACCTGTTTATAGTTGTCTTTGCTGTAGCTGTTAGCGTTTGTGCTAATCGCTTTTTTGGTGTTTTGTGTAAGTCGTTTATAGCCCATTTAAAc > 1:48194/3‑250 (MQ=255) gATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaagtcgacggaacatctccgctcttgatactccctcggttttgcagattgcgtcgaattcatctaccacttccgggcggagtttgaacaatacctgtttatagttctctttgctgtagctgttagcatttgtgctaatcgcttttttagtgttttgtgtaagtcgtttatagcccatttaaaccgcctt < 1:64671‑M2/251‑247 (MQ=255) gATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaagtcgacggaacatctccgctcttgatactccctcggttttgcagat < 1:510153‑M2/110‑106 (MQ=255) | ACCAGTAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGACGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTAGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACCACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACTCCCTCGGTTTTGCAGATTGCGTCGAATTCATCTACCACTTCCGGGCGGAGTTTGAACAATACCTGTTTATAGTTGTCTTTGCTGTAGCTGTTAGCGTTTGTGCTAATCGCTTTTTTAGTGTTTTGTGTAAGTCGTTTATAGCGCATTTAAACC > 1/89452‑89944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |