| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 5166 | 0 (0.000) | 65 (0.870) | 46/366 | 0.4 | 66.7% | intergenic (+48/‑225) | unknown/unknown | Superoxide dismutase [Cu‑Zn] precursor (EC 1.15.1.1)/hypothetical protein |
| ? | 1 | = 546399 | 65 (0.870) | intergenic (‑236/+37) | unknown/unknown | hypothetical protein/Lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
TCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATAAACGTTGAATGCGCCGAGAGAATTGCCAGCAGTAACCCTGCTTTGCCGTCTAAAAATCCCAATCGGATAAAATACATTTTCACAAAACAACCGATGGCGTGACTGACACCTTGCCATAAGGTGGCTTTTTTACCGGATTTTTCCCGTTGTTCCGCCCAGGCTTTGGCG > 1/546150‑546646 | tCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTCTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGg > 1:577950‑M2/1‑250 (MQ=255) tCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggtt > 1:76253‑M2/1‑240 (MQ=255) tCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttgg > 1:474363‑M2/1‑236 (MQ=255) tGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGGTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttgggg > 1:763275‑M2/1‑234 (MQ=255) ttttGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttggggtgcagatcatagg > 1:660865‑M2/1‑221 (MQ=255) gTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCAc < 1:28365/250‑1 (MQ=255) aTTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTc > 1:171150/1‑250 (MQ=255) ggTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAAAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGt > 1:443672/1‑250 (MQ=255) gTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTc < 1:796051/250‑1 (MQ=255) tgtgTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGGAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCct < 1:787526/234‑1 (MQ=255) gtgtAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACaaa > 1:457402/1‑251 (MQ=255) cGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATaa < 1:170197/251‑1 (MQ=255) ccATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATaaa > 1:391206/1‑250 (MQ=255) gCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATAAACGTTGAAt > 1:566691/1‑251 (MQ=255) ccTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATAAACGTTGAATg < 1:734503/251‑1 (MQ=255) ccTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATAAACGTTGAATg < 1:161173/251‑1 (MQ=255) ggCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATAAAc > 1:274995/1‑228 (MQ=255) gCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttgggg > 1:818730‑M2/1‑145 (MQ=255) gCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATAAACGTTGAATGCGCCGAGAGAATTGc > 1:871728/1‑250 (MQ=255) cttttccaataaatGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACTTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttggggtgcagatcacttttttgtttcggaaagcggattatttaattacaccacacgccatacgcggaccgccgccgccaagtggggccgggtgatcg > 1:438090‑M2/7‑141 (MQ=255) caATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttggggtgcagatcacttttt < 1:636592‑M2/167‑33 (MQ=255) caATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATc > 1:502589/1‑201 (MQ=255) caATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATAAACGTTGAATGCGCCGAGAGAATTGCCAGCAGTAAc > 1:542360/1‑250 (MQ=255) caATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttggggtgcagatcacttttttgtttcggaaagcggattatttaattacac > 1:296642‑M2/1‑135 (MQ=255) aTAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATAAACGTTGAATg < 1:33852/223‑1 (MQ=255) aTAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttggggtgcagatcacttttttgtttcggaaagcggattatttaattacaccacacgccatacgcggaccgccgccgccaagtggggccgggtgatcggagtggtta < 1:711632‑M2/251‑119 (MQ=255) aaaTGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATAAACGTTGAATGCGCCGAGAGAATTGCCAGCAGTAACCCTGc < 1:736393/251‑1 (MQ=255) 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1:402779‑M2/1‑30 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttggggtgcagatcacttttttgtttcggaaagcggattatttaattacaccacacgccatacgcggaccgccgccgccaagtggggccgggtgatcggagtggttatcgccaccagcgtggatcatgag < 1:93541‑M2/171‑142 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttggggtgcagatcacttttttgtttcggaaagcggattatttaattacaccacacgccatacgcggaccgccgccgccaagtggggccgggcgatcggagtggttatcgccaccagcgtggatcatgagggagtgaccgcgcacgtcgtctaagtgtttaatgcgtggggctaaaaccgggttagcggctgcgccgtcgtgtaatacgg < 1:672014‑M2/251‑222 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttggggtgcagatcacttttttgtttcggaaagcggattatttaattacaccacacgccatacgcggaccgccgccgccaagtggggc < 1:282042‑M2/129‑100 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGgtgtccaggttttgggg < 1:592352‑M2/47‑18 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAATCCGCATATTTTATAAACGTTGAATGCGCCGAGAGAATTGCCAGCAGTAACCCTGCTTTGCCGTCTAAAAATCCCAATCGGATAAAATACATTTTCACAAAACAACCGATGGCGTGACTGacac > 1:378885/1‑218 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |