| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 601439 | 0 (0.000) | 39 (0.630) +GCACGACTTGCCCGATGATTTGCAGGTTTTCGGCTTCAGCTTGGGTTAGTTGGATTGGTGGATAT |
18/300 | 1.8 | 100% | coding (677/699 nt) | unknown | Phage repressor protein cI |
| ? | 1 | 1204880 = | 0 (0.000) | intergenic (+318/+259) | unknown/unknown | [NiFe] hydrogenase metallocenter assembly protein HypE/hypothetical protein | |||||
GGACAGAATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAATTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTAAAAAGGGCGGTTTTAGCCACTTAATTGTAGAAAAACAAAAAGGCGTTTAAAAAACGTTTAAAGACCGTTTAAATTACGCTTTTGCCGATGTAGGCAACTTGTCCGATTATCTCCAATTTGTCCGCTTCCTCTTTGGTTAGCGTTATCGGGGCGTACTCTTCTTTGTTGTCTGAAATGAGCTCTATGCCGTTCCAGTTGAGTTTTACGCGCTTAACCCATACGCTTTCGCGGTTTTGCACTAAATAGATTTTATCGCCCTTGATCTCTTT > 1/601246‑601617 | gggcagaATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAGTTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTAAAAAGGGCGGTTTTAGCCACTTAATTGTAGAAAAACAAAAAGGCGTTTAAAAAACGTTTAAAGCCCGTTTAAATAAGGTTTTTCCCGATGTgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattg > 1:528426‑M1/4‑194 (MQ=255)gggcagaATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAGTTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTAAAAAGGGCGGTTTTAGCCACTTAATTGTAGAAAAACAAAAAGGCGTTTAAAAAACGTTTAAAGCCCGTTTAAATAAGGTTTTTCCCGATGTgcacgacttgcccgatgatttgcaggttttcggcttcagcttgggttagttggattg > 1:737517‑M1/4‑194 (MQ=255) 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GGACAGAATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAATTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTAAAAAGGGCGGTTTTAGCCACTTAATTGTAGAAAAACAAAAAGGCGTTTAAAAAACGTTTAAAGACCGTTTAAATTACGCTTTTGCCGATGTAGGCAACTTGTCCGATTATCTCCAATTTGTCCGCTTCCTCTTTGGTTAGCGTTATCGGGGCGTACTCTTCTTTGTTGTCTGAAATGAGCTCTATGCCGTTCCAGTTGAGTTTTACGCGCTTAACCCATACGCTTTCGCGGTTTTGCACTAAATAGATTTTATCGCCCTTGATCTCTTT > 1/601246‑601617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |