| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | 524688 = | 95 (1.080) | 42 (0.500) +TGTCC |
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| ? | 1 | = 621961 | 2 (0.020) | intergenic (+46/‑225) | unknown/unknown | Excinuclease ABC subunit A/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
ATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTACCAATTTCGTTTAAAAACTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCTAAATTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGTAAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTGAAGCCAAAGATGAAAAAGAAAGCGATTGAAATCC > 1/524445‑524937 | attttattttTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACAcc < 1:269566/251‑1 (MQ=255) cATAAAATGACCGCACTTTTGACCTCACTTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCATCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGTCATTTGAATCCATTCACCCATTGTGTCCATGGCAACGTGCGACACGTAGTCTATTGCTAAACTTTGAATTAATTAAAAACGGTTAGTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCTCCCAAAACCCGGACACCTAAtg > 1:706914/1‑233 (MQ=255) cATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGt < 1:552308/251‑1 (MQ=255) cATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGt > 1:889396/1‑251 (MQ=255) aTAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGtc < 1:182541/251‑1 (MQ=255) cTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGtcttactcttatc > 1:497190/1‑246 (MQ=255) cTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAAt < 1:788499/251‑1 (MQ=255) 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ttccgaccgcactttgatctgcaccccaaaacctggacaCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTACCAATTTCGTTTAAAAACTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGTAAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAAt > 1:828780‑M1/40‑251 (MQ=255) ttccgaccgcactttgatctgcaccccaaaacctggacaCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTACCAATTTCGTTTAAAAACTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGTAAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAAt > 1:185103‑M1/40‑251 (MQ=255) aTTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGTAAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAAt < 1:330172/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cacCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGACAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGTAAAATCCCCTTATATAAAccc > 1:453298/1‑222 (MQ=255) cacCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGTAAAATCCCCTtatat > 1:169288/1‑216 (MQ=255) cacCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGTAAAATCCCCTtatat > 1:243785/1‑216 (MQ=255) cacCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTACGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGTAAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTGAAGCCAAAGa > 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< 1:629087‑M1/226‑1 (MQ=255) | ATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTACCAATTTCGTTTAAAAACTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCTAAATTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGTAAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTGAAGCCAAAGATGAAAAAGAAAGCGATTGAAATCC > 1/524445‑524937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |