| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | 1 | = 380765 | 0 (0.000) | intergenic (+247/‑3) | unknown/unknown | Mannose‑6‑phosphate isomerase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
TTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCATAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATTTAGCCACCTCTCATATACCGAAATCCTGCTCGGTGACTAGCTTGATAATTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAGGACATAATCTGCAACTTAAATTATATGCCGATTTTTTTGGGGTGTAGATCAAAGTGCAGTTGAAAAAACAATCATTTTTTAACCGCACTTTTTCCTATCTATTCAAACTCCAATTCCACCGCACTTTCACCGAACAGTGCCGCCAGTTCGGTGAGCAGTTCGTCCGTCGGGTTGACCGACCATTGCACGCCCATTTTAACCAGCGCTCTGCCCTGCGGGCTTTGGTAGTAAATATGCACCGGCAGCGAATTGCCG > 1/171604‑172102 | tttAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGGTTGTTTC‑AGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATTTAGCCACCTCTCATATACCGAAATCCTGCTCGGTGACTAGCTTGATAATTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAGGACATAAc < 1:685315‑M1/251‑2 (MQ=255) 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TTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCATAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATTTAGCCACCTCTCATATACCGAAATCCTGCTCGGTGACTAGCTTGATAATTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAGGACATAATCTGCAACTTAAATTATATGCCGATTTTTTTGGGGTGTAGATCAAAGTGCAGTTGAAAAAACAATCATTTTTTAACCGCACTTTTTCCTATCTATTCAAACTCCAATTCCACCGCACTTTCACCGAACAGTGCCGCCAGTTCGGTGAGCAGTTCGTCCGTCGGGTTGACCGACCATTGCACGCCCATTTTAACCAGCGCTCTGCCCTGCGGGCTTTGGTAGTAAATATGCACCGGCAGCGAATTGCCG > 1/171604‑172102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |