| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,460,808 | 737 bp→TACGTGCTTGAATTTATGCTTACAT | unknown | unknown | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1460808 | 1461544 | 737 | 32 [1] | [4] 28 | unknown | unknown |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1460807 | 1 (0.010) | 23 (0.300) +TACGTGCTTGAATTTATGCTTACAT |
16/380 | 2.9 | 91.2% | intergenic (+33/‑216) | unknown/unknown | hypothetical protein/FIG00698722: hypothetical protein |
| ? | 1 | 1461545 = | 4 (0.050) | intergenic (+49/‑619) | unknown/unknown | FIG00698722: hypothetical protein/Bacterial non‑heme ferritin (EC 1.16.3.2) | |||||
TAAATCCAAAAATGATACTAGGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GG‑AAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGCGCTTAAATTTAAGCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCTTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1460571‑1460807‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTTCATCACGTTTAACTAGTAATAGTGACCTTTGAATAACTCTGTGTTTTCATTAAATCGTAGTGTTCATTTACTTTGCCACTAATTTCGCATAACATATATTATGTTAAATAAAATAAATGGTAAGTCACTTCTGGGAATTTGAGGTTTGCTCTCTTTAAAAATGA > 1/1461545‑1461771 ||||||||||||||||||||||||| aAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAA < 1:341661/250‑1 TACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACG < 1:613501/228‑1 TACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATAC > 1:303813/1‑227 ACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTt > 1:739068/1‑250 ctaaGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTtt > 1:756241/5‑249 GACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTA > 1:791023/1‑234 ATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAA < 1:268366/251‑1 ATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTC < 1:426022/243‑1 TTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAAT > 1:784907/1‑251 AAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGC‑TCAAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTA > 1:844796/1‑251 aactatttttgggcaagctcaAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGG > 1:346280/22‑250 aactatttttgagcaagctcaAAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGC < 1:236940/230‑1 CGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACc < 1:367120/250‑2 GCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAA < 1:828074/204‑1 CCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATAT < 1:530159/188‑1 ATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGC < 1:51778/136‑1 ATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGAATACCTAAATTTAACCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGC < 1:785375/136‑1 CATTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATA > 1:623113/1‑139 TTTTTATTTTTTGCGCGTACCTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAAC > 1:192171/1‑228 taccTAAATTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAAT > 1:749381/5‑208 AAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGACTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAACATATATTA < 1:358946/251‑1 TTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAACATATATTATGT < 1:641107/251‑1 ATACCCCTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAACATATATTATGTTAAATAAAATAAATGG < 1:334688/251‑1 ccccTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAACATATATTATGTTAAATAAAATAAATGGTAA > 1:814500/5‑251 ccccTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAACATATATT < 1:332040/224‑1 ccccTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAAC > 1:520655/5‑165 TGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTC < 1:562196/143‑1 ATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGT > 1:182044/1‑138 ATACGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAACATATATTATGTTAAATAAAATAAATGGTAAGTCACTTCTGGGAATTTGAGATTTGCTCTCTTTAAAAA < 1:732398/250‑1 CGTGCTTGAATTTATGCTTACATTTTTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTCCATCACGTTTAACCAGTAAGAGTGACCTGTGAATAACTCTGTGTTTTTATTAATCCGTAGCGTTTATTAACGAAGTCACTAAATTCGCATAACATATATTATGTTAAATAAAATAAATGGTAAGTCACTTCTGGGAATTTGAGATTTGCTCTCTTTAAAAATGA > 1:684168/1‑250 ||||||||||||||||||||||||| TAAATCCAAAAATGATACTAGGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GG‑AAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTGCGCGCGCTTAAATTTAAGCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCTTAAAGCCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1460571‑1460807‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTATTGATGTTACAAGGCTTTATTTCTTCAGTTTTCATCACGTTTAACTAGTAATAGTGACCTTTGAATAACTCTGTGTTTTCATTAAATCGTAGTGTTCATTTACTTTGCCACTAATTTCGCATAACATATATTATGTTAAATAAAATAAATGGTAAGTCACTTCTGGGAATTTGAGGTTTGCTCTCTTTAAAAATGA > 1/1461545‑1461771 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |