| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 954,874 | Δ1,649 bp | unknown–unknown | unknown, unknown, unknown | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 954874 | 956522 | 1649 | 76 [0] | [1] 77 | unknown–unknown | unknown,unknown,unknown |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 954873 | 0 (0.000) | 75 (0.890) | 54/410 | 0.3 | 100% | intergenic (+4/‑275) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑GAG/Integrase |
| ? | 1 | 956523 = | 0 (0.000) | intergenic (+503/‑78) | unknown/unknown | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
CAGTATCGTTATCGGCAACATCAATTCGCACAGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/954615‑954873‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGGAGCTTTAAAT > 1/956523‑956750 CAGTATCGTTATCGGCAACATCAATTCGCACAGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAG > 1:825255/1‑250 TTATCGGCAACATCAATTCGCACAGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATT < 1:784743/250‑1 GCAACATCAATTCGCACAGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAA > 1:138364/1‑251 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1:195055/209‑1 ACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTC < 1:735294/251‑1 CAGCTGTAATAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAAT < 1:755185/211‑1 CTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTAT < 1:27699/250‑1 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ATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAA > 1:416868/1‑251 ATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAA > 1:74510/1‑237 ATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCT < 1:741924/193‑1 CTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAAT < 1:195555/251‑1 CTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATG < 1:472877/105‑1 GGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATT > 1:550371/1‑251 GGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACAT < 1:194549/250‑1 GGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAAC > 1:394494/1‑235 GGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGAT > 1:123421/1‑216 GGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAAT < 1:889060/116‑1 GTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAAC < 1:415579/234‑1 GACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGA > 1:86388/1‑251 GACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGC < 1:563257/176‑1 ACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTA > 1:514615/1‑150 ACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATC > 1:812482/1‑136 ACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTT > 1:300206/1‑92 CCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAG < 1:25103/50‑1 TCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAG > 1:47478/1‑183 TGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGG < 1:549983/251‑1 GTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGAT > 1:160071/1‑193 GTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGT < 1:633935/69‑1 TCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGGAGCTTTAAAT < 1:346183/249‑1 GAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGG > 1:545011/1‑230 TTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTC < 1:123759/105‑1 CAGTATCGTTATCGGCAACATCAATTCGCACAGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/954615‑954873‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcaccaatttCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTCTTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCTCACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGGAGCTTTAAAT > 1/956523‑956750 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |