| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 601175 = | 0 (0.000) | 78 (0.880) | 56/430 | 0.3 | 96.9% | intergenic (‑8/‑107) | unknown/unknown | UPF0758 protein YicR/hypothetical protein |
| ? | 1 | 1514988 = | 5 (0.060) | coding (540/1014 nt) | unknown | Outer membrane receptor for lactoferrin or transferrin, TonB‑dependent protein A | |||||
TTTAAACGGTCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAATTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGTCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/601421‑601175‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTT > 1/1514988‑1515232 TTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGAC < 1:241968/251‑1 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1:254556/201‑1 GTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCG < 1:854161/137‑1 AACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACAGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAG < 1:123678/236‑1 CCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCA > 1:298841/1‑251 CCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCA > 1:459959/1‑251 GTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATG < 1:675959/223‑1 ATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCT > 1:503186/1‑142 TTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTAC > 1:624112/1‑67 TTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTA > 1:593489/1‑251 TTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTA > 1:79751/1‑251 TTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTA > 1:741437/1‑251 TTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTG > 1:121354/1‑216 CTAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAA > 1:676695/1‑85 TAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTC < 1:729429/251‑1 TAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTC < 1:817213/251‑1 TAATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTC < 1:44615/251‑1 AATATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAG < 1:663501/218‑1 ATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTC > 1:82989/1‑247 ATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATG < 1:508716/160‑1 ATTAAGTGGTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAA < 1:749879/80‑1 GTTGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGAACCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAAC > 1:237534/1‑245 TGGTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTT > 1:532549/1‑251 GTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTT > 1:696615/1‑251 GTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAAC > 1:356418/1‑241 GTTACAGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGC > 1:590650/1‑225 AGGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACC < 1:649653/159‑1 TTTAAACGGTCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAATTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGTCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/601421‑601175‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGACGGACAATCCTCTTGCAAAAGAAAATAGTTATATGTACCGCCCGTACCCGGTACGGCAACCTGGCGGGAATAACGCTGTCTTCCCCTGCGTGCATCACGATGAATTTGTGCTTCTTTGCCTCGACGATCCGTGTAGATGAATAGACCCTCAAACCCATCGTTTTTTCCCGCTATTGCAATGGAATGTGTGGAAGCACGATTTTTACTGGCATAGGCGTTCTTAGTCTGTAACCCCCAGTTTT > 1/1514988‑1515232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |