| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 91097 | 95 (1.080) | 105 (1.210) | 59/424 | 0.2 | 69.2% | coding (32/690 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | 101597 = | 0 (0.000) | coding (842/1113 nt) | unknown | DNA transposition protein Mup03, A | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
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tgtcaccccAGTTGCATTGACGGGACCCACT‑‑‑‑CTTTAAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAG < 1:421218/242‑1 TGTCATCACAGTTGCATTGACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGga > 1:784616/1‑148 TGTCATCACAGTTGCATTGACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAG > 1:529319/1‑251 TGTCATCACAGTTGCATTGACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAG > 1:615903/1‑251 CATCACAGTTGCATTGACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGg < 1:371756/158‑2 CATCACAGTTGCATTGACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATG < 1:79987/149‑1 tcacAGTTGCATTGACGGGCCCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAAT < 1:556842/189‑1 ccacAGTTGCATTGACGGGCCCCACG‑‑‑‑CCTTAAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCT < 1:366451/247‑1 TTGCATTGCCGGGCCCCACG‑‑‑‑CTTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGA < 1:249276/250‑1 GCATTGACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGA > 1:575064/1‑248 GCATTGACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATAC > 1:816181/1‑233 ATTGACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACC < 1:687312/251‑1 ttgcCGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCCCCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCC < 1:696335/247‑1 TTGACGGGCCCCACG‑‑‑‑CTTTCAATATGCGCCCCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATGTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCC < 1:602829/251‑1 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GACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAA > 1:498204/1‑251 GACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAAT > 1:138788/1‑180 CGGGACCCCCG‑‑‑‑CCTTCAATAGGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAAC < 1:168212/250‑1 GGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCG < 1:714328/250‑1 GGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCG < 1:208900/250‑1 GGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCG < 1:240729/250‑1 gccccgCG‑‑‑‑CCTTAAATAGGCCCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGT < 1:598724/244‑1 CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTTGCACTTG > 1:805908/1‑251 TTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTTGCACTTGC > 1:270499/1‑250 TTCAATAGGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGga < 1:168926/117‑3 CAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTTGCACTTGCCG > 1:178269/1‑250 cCCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTTGCACTTGCCGCACGTTTCAAG < 1:481786/250‑1 GCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATac < 1:422000/120‑3 GCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACT < 1:483626/199‑1 GCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGA > 1:323958/1‑171 CCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCG < 1:629650/223‑1 CCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAG > 1:636931/1‑200 CCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTTGCACTTGCCGCACGTTTCAAGCGTTCATAGCAAGAT < 1:662562/250‑1 CCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAG < 1:171590/188‑1 TTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTTGCACTTGCCGCACGTTTCAAGCGTTCATAGCAAGATCCAAAC < 1:312898/251‑1 TTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTTGCACTTGCCGCACGTTTCAAGCGTTCATAGCAAGATCCAAACT < 1:686635/251‑1 GCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTTGCACTTGCCGCACGTTTCAAGCGTTCATAGCAAGATCCAAACTGAGGGCGCTCATTGCGAAAATAGTCa > 1:720151/1‑250 GCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAG < 1:206808/158‑1 GCCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAG > 1:848306/1‑156 CCGTTAACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAAT < 1:71961/104‑1 ACCGTCCCCGTTGACCCATTCCATCGCCTCAATGCCGGCAACGGTACGGATGAGCGATGGGTACATACGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTTGCACTTGCCGCACGTTTCAAGCGTTCATAGCAAGATCCAAACTGAGGGCGCTCATTGCGAAAATAGTCAGCGCGGA > 1:382670/1‑251 TTTTGCAACTTTCATCGTCTAAAATTGCGATCCCTTTAACTGGAGAGGTAAATTCAAAGGCATCATAATACTCGTCTTTTTTGATTGTGGTTCTTCTTTCATTTGTTAAGTTTACTGCATTCTTGATGATATCTTTGCCGCTTACTATTGTCATCAGAGTTGCATTGACGGGACCCACG‑‑‑‑CCTTCAATATGCGCACCGCCGATACCCAAGCCGCTTTTGCTCTCAAAAATGATGATTTTTCTGCCGTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/90849‑91097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaCCGTCCCCGTTGACCCATTCCATTGCTTCAATGCCGGCAACGGTACGAATGAGCGATGGATACATGCGGCTCAACGCATAAGTGCCATCTCTTAAATAGGTTTGGTGGGTTTTTGGGATTTCGCGCAAGATTTTGCGCTTAATACTAGAGGGGCTTGGGATAACCCAACCGTTCGCACTTGCCGCACGTTTCAAGCGTTCATAACAAGATCCAAACTGAGGGCGCTCATTACGGAAATAGTCGGCGCGGA > 1/101597‑101846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |