| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 602,417 | (A)7→6 | coding (10/255 nt) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 602,411 | 0 | A | . | 100.0% | 259.9 / NA | 62 | coding (4/255 nt) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (31/31); total (31/31) | |||||||||||
AACTTACGATTAAAATCTATAAAAGTACCGTTCAAAAAATAGCCATTTAACTTTAAAAGAATATTTTTAAAGTTGCCACAACTACTTTTGTGTATTAATATTCTCATTAGATTAACGAATGAAGTTATCTAATGAGGACATAAATGGAAACTAAAAAAACAGCTATTGATTGGCATATACGTGATTAACGCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATGAAAAAAACACTTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTTTACAAGATGCTGGAGCTAAATTTAATAGAGATGGGGCGTTAGATTTATTTGAG > 1/602183‑602638 | gcccggaagtggtcgatgaattcgacgcaatctgcaaaaccgagggagtatcaagagcggagatgttccgtcgactcttaaatatttacacaaaacttacaaaatagtcgttgcgtagttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGa > 1:7484‑M2/191‑245 (MQ=255) ctgcaaaaccgagggagtatcaagagcggagatgttccgtcgacccttaaatatttacacaaaacttacaaaatagtcgttgcgtagttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGa < 1:438944‑M2/55‑1 (MQ=255) caaaaccgagggagtatcaagagcggagatgttccgtcgactcttaaatatttacacaaaacttacaaaatagtcgttgcgtagttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTAt < 1:753254‑M2/94‑1 (MQ=255) agtatcaagagcggagatgttccgtcgactcttaaatatttacacaaaacttacaaaatagtcgttgcgtagttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATGaa > 1:852092‑M2/145‑184 (MQ=255) gttccgtcgactcttaaatatttacacaaaacttacaaaatagtcgttgcgtagttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTa > 1:796452‑M2/127‑251 (MQ=255) cttaaatatttacacaaaacttacaaaatagtcgttgcgtagttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAgtg < 1:190961‑M2/83‑1 (MQ=255) tatttacacaaaacttacaaaatagtcgttgcgtagttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATg > 1:108238‑M2/109‑203 (MQ=255) gtcgttgcgtagttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGt > 1:84513‑M2/85‑251 (MQ=255) tcgttgcgtagttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCggg < 1:695265‑M2/166‑1 (MQ=255) gcgtagttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATAc < 1:748855‑M2/72‑1 (MQ=255) gttatattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCgg < 1:193660‑M2/119‑1 (MQ=255) atattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGAt > 1:209148‑M2/71‑161 (MQ=255) atattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACAt > 1:876911‑M2/71‑193 (MQ=255) atattatataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCt > 1:329059‑M2/71‑212 (MQ=255) atataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAaataat < 1:60624‑M2/103‑1 (MQ=255) ataatataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTg < 1:678300‑M2/89‑1 (MQ=255) atataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAAt > 1:808483‑M2/61‑207 (MQ=255) atataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGAc < 1:35448‑M2/175‑1 (MQ=255) atataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGAc < 1:492372‑M2/175‑1 (MQ=255) atataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACt > 1:788692‑M2/61‑236 (MQ=255) atataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCgagag < 1:562869‑M2/185‑1 (MQ=255) atataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCgag < 1:566098‑M2/183‑1 (MQ=255) atataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAAtgtg > 1:641865‑M2/61‑251 (MQ=255) atataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAAtgtg > 1:475782‑M2/61‑251 (MQ=255) tataatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGc < 1:645656‑M2/192‑1 (MQ=255) aatattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATAc > 1:40799‑M2/57‑128 (MQ=255) atattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACAt > 1:575812‑M2/56‑178 (MQ=255) atattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGa > 1:158562‑M2/56‑250 (MQ=255) atattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGa > 1:498389‑M2/56‑250 (MQ=255) tattaaccacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCg < 1:774786‑M2/105‑1 (MQ=255) cacgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGc < 1:885419‑M2/198‑1 (MQ=255) acgtaagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTg > 1:122286‑M2/47‑251 (MQ=255) taagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGa < 1:76935‑M2/207‑1 (MQ=255) taagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGAt < 1:220036‑M2/208‑1 (MQ=255) taagcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGAt < 1:298981‑M2/208‑1 (MQ=255) agcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCg < 1:520345‑M2/105‑1 (MQ=255) agcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGc > 1:360021‑M2/42‑182 (MQ=255) gcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTatga < 1:202420‑M2/171‑1 (MQ=255) gcaagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGAc < 1:18003‑M2/175‑1 (MQ=255) caagagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACg > 1:369466‑M2/40‑236 (MQ=255) gagggacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGc < 1:638157‑M2/132‑1 (MQ=255) gacgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGa > 1:736919‑M2/33‑251 (MQ=255) acgccgcaccgaagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGAtt < 1:851134‑M2/137‑1 (MQ=255) aagcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGAt > 1:816247‑M2/21‑228 (MQ=255) gcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTg > 1:422687‑M2/19‑107 (MQ=255) gcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGAc > 1:421652‑M2/19‑130 (MQ=255) gcttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAAt > 1:128138‑M2/19‑251 (MQ=255) cttataaatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAg > 1:33177‑M2/18‑235 (MQ=255) caaagattaacgAGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAgtgt > 1:844163‑M2/13‑96 (MQ=255) aatgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATag < 1:599478‑M2/240‑1 (MQ=255) tgattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATagag > 1:576347‑M2/10‑251 (MQ=255) gattaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCt < 1:647070‑M2/88‑1 (MQ=255) attaacgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAgaga < 1:755370‑M2/243‑1 (MQ=255) acgCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAAt < 1:300971‑M2/147‑1 (MQ=255) cgGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGAt < 1:734749/206‑1 (MQ=255) ggAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAAt > 1:92240/1‑231 (MQ=255) ggAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATag < 1:475571/233‑1 (MQ=255) gagaTACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATCTAATAGAGATGAGGCATTAGat < 1:719549/248‑1 (MQ=255) agaTACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAgtgt > 1:258505/1‑75 (MQ=38) aTACAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACAt > 1:312612/1‑103 (MQ=255) cAAAAATGACAACTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGCATTAGATTTATTTGAg > 1:854832/1‑251 (MQ=255) cTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGAttt > 1:173283/1‑184 (MQ=255) cTCAAAAATATG‑AAAAAACACCTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTCTACAAGATGCGGGAGCTAAATTTAATAGAGATGAGGca < 1:239382/224‑2 (MQ=255) | AACTTACGATTAAAATCTATAAAAGTACCGTTCAAAAAATAGCCATTTAACTTTAAAAGAATATTTTTAAAGTTGCCACAACTACTTTTGTGTATTAATATTCTCATTAGATTAACGAATGAAGTTATCTAATGAGGACATAAATGGAAACTAAAAAAACAGCTATTGATTGGCATATACGTGATTAACGCGCGGCAGGAGATACAAAAATGACAACTCAAAAATATGAAAAAAACACTTTTAAGATTTGAAATCTTTCATACAATCAAAAGTGTAGCTGATTATGTAAATAATCGTGATGACATTGCGGACATTATCGCTGCAGATTACGCTTTAATCGCATGCGAAGAAAGCGGGTATGATGACTATTCGAGAGAATGTGCAGACGCACACTTGGATTTTTTACAAGATGCTGGAGCTAAATTTAATAGAGATGGGGCGTTAGATTTATTTGAG > 1/602183‑602638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |