| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 135,308 | (C)7→5 | intergenic (+57/‑93) | unknown → / → unknown | Ribosome‑associated inhibitor A/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 135,303 | 0 | C | . | 100.0% | 284.6 / NA | 68 | intergenic (+52/‑99) | unknown/unknown | Ribosome‑associated inhibitor A/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (30/38); total (30/38) | |||||||||||
| * | 1 | 135,304 | 0 | C | . | 100.0% | 284.6 / NA | 68 | intergenic (+53/‑98) | unknown/unknown | Ribosome‑associated inhibitor A/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (30/38); total (30/38) | |||||||||||
CCTAAGGGCTTCTCTGTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCTCCCCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATAACACCAATCCCGGGAGAATTTGCCGGCGCCGATTATCTACTATCTGACATTGATGCAAAACGTTGGGCTTTTGA > 1/135060‑135541 || ccTAAGGGCTTCTCTGTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCTccccctt > 1:335352/1‑248 (MQ=255)ccTAAGGGCTTCTCTGTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCTccccctt > 1:681748/1‑248 (MQ=255) aaGGGCTTCTCTGTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCTcccccttcttg < 1:448253/251‑7 (MQ=255) gggCTTCTCTGTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCTcccccttcttgt > 1:865622/1‑243 (MQ=255) cTTCTCTGTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCtt > 1:503705/1‑251 (MQ=255) tctcTGTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCttt > 1:27703/1‑250 (MQ=255) ctGTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTcc < 1:680710/244‑1 (MQ=255) ctGTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCta < 1:700170/251‑1 (MQ=255) gTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCtata > 1:668048/1‑251 (MQ=255) aTGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAGAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATaaac < 1:368133/250‑1 (MQ=255) aTGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATaaac < 1:168305/250‑1 (MQ=255) aTGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATaaac < 1:261758/250‑1 (MQ=255) ttCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAAcc < 1:291160/251‑1 (MQ=255) gCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATc < 1:334186/250‑1 (MQ=255) cccccGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAAt < 1:13338/250‑1 (MQ=255) ccGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATaaac > 1:541502/1‑233 (MQ=255) ccGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAAcc < 1:4574/238‑1 (MQ=255) gCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACtt < 1:401678/250‑1 (MQ=255) aTCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATaaac > 1:637282/1‑223 (MQ=255) cTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTg > 1:381515/1‑249 (MQ=255) cTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCt < 1:494509/251‑1 (MQ=255) ccAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATAc < 1:800610/251‑1 (MQ=255) gTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAAcc < 1:743793/216‑1 (MQ=255) tGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGc < 1:668145/250‑1 (MQ=255) tGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGc < 1:438783/250‑1 (MQ=255) tGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGc < 1:810146/250‑1 (MQ=255) gagGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAAcc > 1:269615/1‑208 (MQ=255) ggAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCt > 1:137863/1‑231 (MQ=255) tatGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTcc > 1:860740/1‑188 (MQ=255) gTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATaaac < 1:217133/192‑1 (MQ=255) gTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATc > 1:459328/1‑204 (MQ=255) gTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCt > 1:398266/1‑222 (MQ=255) gTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGct < 1:862397/238‑1 (MQ=255) gTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCa > 1:388225/1‑251 (MQ=255) gCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAgg > 1:246805/1‑249 (MQ=255) cATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTaa > 1:263902/1‑251 (MQ=255) tCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAgg < 1:731766/251‑1 (MQ=255) tCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAgg < 1:679363/251‑1 (MQ=255) ttGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGaa > 1:320295/1‑233 (MQ=255) agaCAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTAtttttt > 1:263716/1‑248 (MQ=255) cAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAg > 1:867789/1‑251 (MQ=255) gCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGtt > 1:208361/1‑251 (MQ=255) cTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAg < 1:197038/248‑1 (MQ=255) cTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAg < 1:891847/248‑1 (MQ=255) tCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTAc < 1:206976/251‑1 (MQ=255) caacaaGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATc > 1:503922/1‑159 (MQ=255) acaaGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTaaaaaa < 1:896116/227‑1 (MQ=255) gCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGGAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCt > 1:885036/1‑165 (MQ=255) gCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGAt > 1:168719/1‑154 (MQ=255) tCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACg < 1:128901/251‑1 (MQ=255) ccgccgCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGAt < 1:766018/251‑1 (MQ=255) gcgcAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGa > 1:825839/1‑186 (MQ=255) gcAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATaaac > 1:753204/1‑113 (MQ=255) cAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTa > 1:104159/1‑219 (MQ=255) cAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATaa < 1:71723/250‑1 (MQ=255) gaagaaCGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATAaca > 1:120263/1‑250 (MQ=255) gaagaaCGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTGCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATAc < 1:183905/147‑1 (MQ=255) aagaaCGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATAac < 1:665773/248‑1 (MQ=255) aCGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATAac < 1:689095/244‑1 (MQ=255) cGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTa < 1:58853/211‑1 (MQ=255) gCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCCCTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTa < 1:549630/128‑1 (MQ=255) gCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAAt < 1:682685/118‑1 (MQ=255) cGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATc > 1:489157/1‑103 (MQ=255) gAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGaa < 1:365838/155‑1 (MQ=255) tAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATAACACCAATCCCGGGAGAATTTGCCGGCGCCGAtt > 1:106743/1‑251 (MQ=255) acgcccGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATAACACCAATCCCGGGAGAATTTGCCGGCGCCGATTATctac < 1:372325/248‑1 (MQ=255) cGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTAt < 1:201433/180‑1 (MQ=255) cACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATAACACCAATCCCGGGAGAATTTGCCGGCGCCGATTATCTACTATCTGACATTGATGCaaa > 1:898151/1‑251 (MQ=255) cTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATaaac < 1:608497/53‑1 (MQ=255) cTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATAacac > 1:146487/1‑194 (MQ=255) gTTTCTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATAACACCAATCCCGGGAGAATTTGCCGGCGCCGATTATCTACTATCTGACATTGATGCAAAACGTTGGGCTTTTGa > 1:21866/1‑251 (MQ=255) cTAATTTTCT‑‑CCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAGTACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTc < 1:526705/152‑1 (MQ=255) || CCTAAGGGCTTCTCTGTTGATGCTTCCATCGGCACCCCGTTCGGCAATCTGATTGCCAGTGCCGAAGAGGAAGATATGTACAAAGCCATCAACGACGTAGAAGAAAAATTGGAGAGACAGCTCAACAAGCTACAGCATAAGAGTGAATCCCGCCGCGCAGAAGAACGCTTAAAAGATTCGTTTAATGAATAAAAAACACCCGTGAAAATGACCGCACTTTAGAAGTGCGGTTTCTAATTTTCTCCCCCCCTTCTTGTCCTTTCCTATAAACAAACCATTTATCAATAGATAACTTATTGCTAGAATACAGCTTCGCTTTCTTTAAATTCATAAGGCTAAGGAATGTTAAAAAAAGTTATTTTTTCTGTAGTTACATTACTATTAGTCGGATGTGCAGACGATCCTATAACACCAATCCCGGGAGAATTTGCCGGCGCCGATTATCTACTATCTGACATTGATGCAAAACGTTGGGCTTTTGA > 1/135060‑135541 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |