| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,152,044 | (T)9→8 | intergenic (+23/‑274) | unknown → / → unknown | Molybdenum transport system protein ModD/TldD protein, part of TldE/TldD proteolytic complex |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,152,036 | 0 | T | . | 100.0% | 152.5 / NA | 37 | intergenic (+15/‑282) | unknown/unknown | Molybdenum transport system protein ModD/TldD protein, part of TldE/TldD proteolytic complex |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (15/22); total (15/22) | |||||||||||
ATATTATTCAGTTGGATAAATGGTCGCCGGAACAGGTTCAACAGGCATTGGCTTTGTTAAAAAAGCAAAGTAAAAAAACGCTCCTTTCTGTTGCCGGCGGGGTGAATAAAAACAACATAGCAGATTATGCCAAGTTAGGGATAAATTTATTTATCATCTCCGTGCCTTACTATGCACCGCCGGAAGATATTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCACTTTTTTTTTAAATAGTTAAAAAACACAACGCAGAAATTCTTAAAAAAAAGTTATTAAAAGTGCGGTTAAAAAACAAATTAAAAATTCACCGTACTTTTTATTCCCCTCCACAATTCAACAAAATAGAATTTATACCCTTAAATAAATTGCGGATAAACCGCTCTTTTTCTTTGGAAAATATCGGATTTATTGCCATTTTCAGGTAACTTTCCTTTTCGGTTTTGGCGGAAAATACGTTATAATCC > 1/1151792‑1152280 | atatTATTCAGTTGGATAAATGGTCGCCGGAACAGGTTCAACAGGCATTGGCTTTGTTAAAAAAGCAAAGTAAAAAAACGCTCCTTTCTGTTGCCGGCGGGGTGAATAAAAACAACATAGCAGATTATGCCAAGTTAGGGATAAATTTATTTATCATCTCCGCGCCTTACTATGCACCGCCGGAAGATATTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCACttttttt > 1:73125/1‑251 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atatTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCAC‑TTTTTTTTAAATAGTTAAAAAACACAACGCAGAAATTCTTAAAAAAAAGTTATTAAAAGTGCGGTTAAAAAACAAATTAAAAATTCACCGTACTTTTTATTcc > 1:392120/1‑161 (MQ=255) atatTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCAC‑TTTTTTTTAAATAGTTAAAAAACACAACGCAGAAATTCTTAAAAAAAAGTTATTAAAAGTGCGGTTAAAAAACAAATTAAAAATTCACCGTACTTTTTATTCCCCTc > 1:750574/1‑165 (MQ=255) atatTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCAC‑TTTTTTTTAAATAGTTAAAAAACACAACGCAGAAATTCTTAAAAAAAAGTTATTAAAAGTGCGGTTAAAAAACAAATTAAAAATTCACCGTACTTTTTATTCCCCTCCACAATTCAACAAAATAGAATTTATAccc > 1:479488/1‑194 (MQ=255) atatTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCAC‑TTTTTTTTAAATAGTTAAAAAACACAACGCAGAAATTCTTAAAAAAAAGTTATTAAAAGTGCGGTTAAAAAACAAATTAAAAATTCACCGTACTTTTTATTCCCCTCCACAATTCAACAAAATAGAATTTATACCCTtaaat < 1:702181/200‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |